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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001162`

染色体: Chr08 坐标: 9294118-9295704 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001162`
名称	SmilChr08G001162
描述	11S globulin seed storage protein Ana o 2.0101-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9294118 - 9295704 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000746`
GeneID	`131000746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000746`
原始查询	`LOC131000746`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11S globulin seed storage protein Ana o 2.0101-like
产物	11S globulin seed storage protein Ana o 2.0101-like
Arabidopsis	`AT1G07750` (AT1G07750) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837290] identity=77.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0116000` - identity=66.8; qcov=0.997; evalue=1.33e-173; confidence=high
GO	GO:0045735 (nutrient reservoir activity)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057782786.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057782786.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782786.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782786.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9294753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B52,D11
`Chr8:9294873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B139,B25,C10,C46
`Chr8:9295041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B52,D11
`Chr8:9295148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:9295203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B6,C37,C75
`Chr8:9295510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B60,B87,C38
`Chr8:9295609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782786.1

356 aa

178

356

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 10-157 aa PF00190 Cupin_1 199-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782786.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	10	157	2.6e-48	164.2	Cupin
`XP_057782786.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	199	334	2.6e-48	164.2	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926803.1
ACCTATCAACCCCTTTTATTCATCAAACTCTCCAAATCTTTTTTGTAGCTTCACATCAGCAATTCAAGAGATATGGATATTGATTTGACACCCAAGTTGCCCAAGAAGATCTACGGTGGAGACGGCGGGTCGTACCACGCGTGGTGCCCCAACGACCTCCCTATGCTCAAAGACGGCAACATCGGCGCCGCCAAGCTCTCCCTCGAGAAGAACGGCTTCGCACTGCCGCGCTACTCCGATTCCGCCAAAGTCGCCTATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000746
ATGGATATTGATTTGACACCCAAGTTGCCCAAGAAGATCTACGGTGGAGACGGCGGGTCGTACCACGCGTGGTGCCCCAACGACCTCCCTATGCTCAAAGACGGCAACATCGGCGCCGCCAAGCTCTCCCTCGAGAAGAACGGCTTCGCACTGCCGCGCTACTCCGATTCCGCCAAAGTCGCCTATGTTCTTCAAGGCAGTGGAGTCGCCGGAATCATCCTGCCGGAGAAGGAGGAGAAGGTGGTGGCGATCAAGAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782786.1
MDIDLTPKLPKKIYGGDGGSYHAWCPNDLPMLKDGNIGAAKLSLEKNGFALPRYSDSAKVAYVLQGSGVAGIILPEKEEKVVAIKKGDAIALPFGVTTWWYNKEDTELGILFLGETKIAHKAGCFTDFFLTGPNGIFTGFTTEFVSRAWDLDEATVKTLVSSQSAKGIVKLPADAKMPEPKKEHYTGMALNCEEAPLDVDIKGGGKVVVLNTKNLPLVGEVGFGADLVKLNGGAMCSPGFSCDSALQVTYIVRGSGRVQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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