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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001165`

染色体: Chr08 坐标: 9300345-9301695 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001165`
名称	SmilChr08G001165
描述	uncharacterized SmilChr08G001165
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9300345 - 9301695 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000748`
GeneID	`131000748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000748`
原始查询	`LOC131000748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOX high mobility group box protein, putative (DUF1635) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817418]; symbol=AT2G28690; hit=AT2G28690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TOX high mobility group box protein, putative (DUF1635) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817418]; symbol=AT2G28690; hit=AT2G28690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G28690` (AT2G28690) TOX high mobility group box protein, putative (DUF1635) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817418] identity=36.8; qcov=1.13; evalue=4.1e-43; confidence=medium
Rice	`Os05g0115100` (OJ1654_B10.11-2) - identity=33.2; qcov=1.04; evalue=5.26e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07795 (DUF1635)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782790.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057782790.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057782790.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782790.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9300691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:9300830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B62,C2
`Chr8:9300977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B108,B131,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782790.1

229 aa

114

229

DUF1635

PF07795 DUF1635 15-198 aa

XP_057782791.1

229 aa

114

229

DUF1635

PF07795 DUF1635 15-198 aa

XP_057782792.1

229 aa

114

229

DUF1635

PF07795 DUF1635 15-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782790.1`	Pfam	`PF07795`	DUF1635	Family	15	198	2.5e-42	146.0	Protein of unknown function (DUF1635)
`XP_057782791.1`	Pfam	`PF07795`	DUF1635	Family	15	198	2.5e-42	146.0	Protein of unknown function (DUF1635)
`XP_057782792.1`	Pfam	`PF07795`	DUF1635	Family	15	198	2.5e-42	146.0	Protein of unknown function (DUF1635)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926809.1
AATAACATTCAATATATAGGAAACCAGCAGTGGGATCACATTTTTTGAGCATTTAAAAAAAACGTCCTTAAAAAATATGAATTGAATAAGGGGCATTTATATTTTGTAAGCTTGCTAATGTCTTGTCCTTTTATTGATCTTCCTCTCTATATAAGTCTCATAACTCTTTTTTCTCAAAACCCCTTTCCCCATAGAATCTTCCACTAAACACATTTCAAGAAAATATATTAATTTCTCAGTTTCATAATGATGGAGATGGC...

XM_057926808.1
AATAACATTCAATATATAGGAAACCAGCAGTGGGATCACATTTTTTGAGCATTTAAAAAAAACGTCCTTAAAAAATATGAATTGAATAAGGGGCATTTATATTTTGTAAGCTTGCTAATGTCTTGTCCTTTTATTGATCTTCCTCTCTATATAAGTCTCATAACTCTTTTTTCTCAAAACCCCTTTCCCCATAGAATCTTCCACTAAACACATTTCAAGAAAATATATTAATTTCTCAGTTTCATAATGATGGAGATGGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000748
ATGATGGAGATGGCTTCATTTTGGAGTTATGAAGAGAATCATGAGATGGAGCAACTGGGTGAGAAGCTGATGTGCACGACTCTCGAACTTGAGAAGCTGAAATCGGAAGCGGTGGAAGAAATGAGGAAAAACAAAGACTACATAAAGCAGTTGATCCATCTTCTCAAATACGCAATTCAAGAGAGAGACGAAGCCAGAAACCAATTCCAGAAGCTTCTCAACAACACCATGCTCCCTTCCCTCCCCCTCTTCCAATCCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057782790.1
MMEMASFWSYEENHEMEQLGEKLMCTTLELEKLKSEAVEEMRKNKDYIKQLIHLLKYAIQERDEARNQFQKLLNNTMLPSLPLFQSNPAKANSSVTESNSLSETYSTPVDSLFDAVSSPDVDQASLIIDDLAKATILPQRGNFLQAVLRAGPLLETLLVAGPLPTWRNPPQFQPLHIPPFSINADHKPYADLSCASVQVQASPMLNFGHMVSAPCGNSYAPLAKRQRFS

XP_057782791.1
MMEMASFWSYEENHEMEQLGEKLMCTTLELEKLKSEAVEEMRKNKDYIKQLIHLLKYAIQERDEARNQFQKLLNNTMLPSLPLFQSNPAKANSSVTESNSLSETYSTPVDSLFDAVSSPDVDQASLIIDDLAKATILPQRGNFLQAVLRAGPLLETLLVAGPLPTWRNPPQFQPLHIPPFSINADHKPYADLSCASVQVQASPMLNFGHMVSAPCGNSYAPLAKRQRFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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