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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001176`

染色体: Chr08 坐标: 9442540-9444783 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001176`
名称	SmilChr08G001176
描述	protein SOSEKI 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9442540 - 9444783 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000758`
GeneID	`131000758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000758`
原始查询	`LOC131000758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOSEKI 5-like
产物	protein SOSEKI 5-like
Arabidopsis	`AT5G59790` (AT5G59790) UPSTREAM OF FLC protein (DUF966) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836100] identity=46.7; qcov=1.15; evalue=5.69e-88; confidence=high
Rice	`Os01g0839200` (OsDSR2) - identity=39.8; qcov=1.09; evalue=7.24e-61; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06136 (SOK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782805.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782805.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782805.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782805.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9442789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B18,B25,B46,C39
`Chr8:9442855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:9443107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9443178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:9443217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr8:9443535`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr8:9443535`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr8:9443559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B22
`Chr8:9443579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:9443627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:9444493`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr8:9444493`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782805.1

332 aa

166

332

SOK

PF06136 SOK 29-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782805.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	29	115	2.2e-49	166.4	SOSEKI protein DIX-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926822.1
TCCAACAGAATGCAGCCAAATGTACTGAATTCTATAAAACTATACGGTAGCACAAGATAATTGTCTGATATGTTTTGTCCCCAGCATCCACACTTGAATCCTCCGCCGTTCACACAACACCGCCAATCATCACCCCTCTATGCTTGATAATATGGCAGCGTCGAGTTCCCGAGCAGGAGGAATGTTATGGAGAGAGGCAGAAATGTGGTCCGAACCTCAAAAGGTGCCTGTGTTGTATTATCTGTCCAGGAATGGGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000758
ATGCTTGATAATATGGCAGCGTCGAGTTCCCGAGCAGGAGGAATGTTATGGAGAGAGGCAGAAATGTGGTCCGAACCTCAAAAGGTGCCTGTGTTGTATTATCTGTCCAGGAATGGGCAGCTCGAGCACCCCCATTTCATGGAGGTTCCTCTCTCCTCTCCCCGCGGCCTCTTTCTCAAAGATGTAATCAACCGCTTGAATGCGCTTCGCGGGAAAGGCATGGCGTTCATGTATTCCTGGTCTTGCAAAAGGAGCTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782805.1
MLDNMAASSSRAGGMLWREAEMWSEPQKVPVLYYLSRNGQLEHPHFMEVPLSSPRGLFLKDVINRLNALRGKGMAFMYSWSCKRSYKNGFVWHDLSENDLIFPAHGHDYILKGSENAFLDVGSPPPDDRRRRNQSCSSIDFEYSVYNRECSSKPAAADVSTQTEIEISPPPSDSSPETLGTLMKADGQVRLRPAAAASSSHRHHHIQRCRSSALLMQLISCGSMPFKDCGTGAGGQGMIGGQHKMRASRGESGGGKLEEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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