Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001178`

染色体: Chr08 坐标: 9455042-9457974 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001178`
名称	SmilChr08G001178
描述	methyl-CpG-binding domain-containing protein 7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9455042 - 9457974 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000761`
GeneID	`131000761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000761`
原始查询	`LOC131000761`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyl-CpG-binding domain-containing protein 7
产物	methyl-CpG-binding domain-containing protein 7
Arabidopsis	`AT5G59800` (MBD7) methyl-CPG-binding domain 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836101] identity=30.25; qcov=0.841; evalue=3.72e-25; confidence=low
Rice	`Os08g0206700` - identity=48.98; qcov=0.166; evalue=2.69e-06; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01429 (MBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000761

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9455481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C42
`Chr8:9456593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:9457048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:9457078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:9457079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:9457345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B62,C77
`Chr8:9457439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782807.1

283 aa

142

283

MBD

PF01429 MBD 34-83 aa PF01429 MBD 135-178 aa

XP_057782808.1

283 aa

142

283

MBD

PF01429 MBD 34-83 aa PF01429 MBD 135-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782807.1`	Pfam	`PF01429`	MBD	Domain	34	83	5.7e-20	71.4	Methyl-CpG binding domain
`XP_057782807.1`	Pfam	`PF01429`	MBD	Domain	135	178	5.7e-20	71.4	Methyl-CpG binding domain
`XP_057782808.1`	Pfam	`PF01429`	MBD	Domain	34	83	5.7e-20	71.4	Methyl-CpG binding domain
`XP_057782808.1`	Pfam	`PF01429`	MBD	Domain	135	178	5.7e-20	71.4	Methyl-CpG binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926825.1
TGAAGTGATTAAAAATATATATGAATTATATGGATATTTATTTCTTGATATAGAAAATACAGTTATGAAGGGCCAAATTCCCAGGTGACCCATCTCACATCACTTCCCCAGTTTGACTCATCGTACAATGTAGAGGACAGAAGTAGGCCCATTTCATAAATAAAAAATTAGCATAATACGAAATTATGAGCAAAAATAATACTTAATCTGAAAACAAACGTGATGAAAAATGATAACAATAACTCACAGTGTTAGCTTGA...

XM_057926824.1
AAAAATATATATGAATTATATGGATATTTATTTCTTGATATAGAAAATACAGTTATGAAGGGCCAAATTCCCAGGTGACCCATCTCACATCACTTCCCCAGTTTGACTCATCGTACAATGTAGAGGACAGAAGTAGGCCCATTTCATAAATAAAAAATTAGCATAATACGAAATTATGAGCAAAAATAATACTTAATCTGAAAACAAACGTGATGAAAAATGATAACAATAACTCACAGTGTTAGCTTGAGCGTTGAGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782807.1_41771
ATGGAGCTACGCCACCACCGCTACCGCTCAGCCTCAAACTCAATGCTGGTTCCCTACGCCCACCGGCAGCTGGCGGTGGTTCCGGCCAGTGCCTCAGGGTCCCGCCTGAGGGTCCCCCGCGGATGGGATGTGGAGGAGGTGCCACGCCCCGACGGCTCCCGCTCTGACAGGTACTACTATGAGCCCGGCTCTGGAAGAAGATTCAGGTCCACTAAAGAAGTTGATAGATATCTCAACGGAGAACCTAACTACTCCTTTGG...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782808.1_41772
ATGGAGCTACGCCACCACCGCTACCGCTCAGCCTCAAACTCAATGCTGGTTCCCTACGCCCACCGGCAGCTGGCGGTGGTTCCGGCCAGTGCCTCAGGGTCCCGCCTGAGGGTCCCCCGCGGATGGGATGTGGAGGAGGTGCCACGCCCCGACGGCTCCCGCTCTGACAGGTACTACTATGAGCCCGGCTCTGGAAGAAGATTCAGGTCCACTAAAGAAGTTGATAGATATCTCAACGGAGAACCTAACTACTCCTTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782807.1
MELRHHRYRSASNSMLVPYAHRQLAVVPASASGSRLRVPRGWDVEEVPRPDGSRSDRYYYEPGSGRRFRSTKEVDRYLNGEPNYSFGSKTAMILPFKRSRGCRYRRMMVSGGKLLRVDNEGSKNHLAVVREAPDILPDGWIVEEVPRKYMNNTDKYYYEPETGVKFRSLVAIERYLADFDEDAPLSKTLEEIMENKPLAKAFKLENHKSSSRRKKDTSREKSQASSFIEPPIKVTWVLASAQGDSWNPFISEALVPDAVK...

XP_057782808.1
MELRHHRYRSASNSMLVPYAHRQLAVVPASASGSRLRVPRGWDVEEVPRPDGSRSDRYYYEPGSGRRFRSTKEVDRYLNGEPNYSFGSKTAMILPFKRSRGCRYRRMMVSGGKLLRVDNEGSKNHLAVVREAPDILPDGWIVEEVPRKYMNNTDKYYYEPETGVKFRSLVAIERYLADFDEDAPLSKTLEEIMENKPLAKAFKLENHKSSSRRKKDTSREKSQASSFIEPPIKVTWVLASAQGDSWNPFISEALVPDAVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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