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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001181`

染色体: Chr08 坐标: 9472941-9476119 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001181`
名称	SmilChr08G001181
描述	glycine-rich RNA-binding protein 4, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9472941 - 9476119 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000764`
GeneID	`131000764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000764`
原始查询	`LOC131000764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein 4, mitochondrial
产物	glycine-rich RNA-binding protein 4%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G59865` (AT5G59865) glycine-rich RNA-binding-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721278] identity=63.8; qcov=0.746; evalue=6.86e-30; confidence=medium
Rice	`Os01g0974701` - identity=62; qcov=0.627; evalue=3.75e-33; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782813.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782812.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782812.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057782813.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782812.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9474982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B62,C77
`Chr8:9475206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:9475722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:9475775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782812.1

115 aa

115

RRM_1

PF00076 RRM_1 19-85 aa

XP_057782813.1

126 aa

126

RRM_1

PF00076 RRM_1 26-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782812.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	19	85	1.2e-20	73.8	RNA recognition motif
`XP_057782813.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	26	96	3.5e-23	82.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093788.1
GTTATTTCTTTAAATCTGTTATGGTTCTATGTTCGTTCGGCTGTTTGATTCGATGGTTATTCTATGGGAATCGTTCGCTAAATTTTCCGCTTCTTTCTGGTTGGCGCTGTAAAGATTGTTCGTCATCTTTTGAGGGTGTGGACAGATAGGGACAGACTTTCTCGGGAAATAATTCAACTTAAAATAAAGGAGCACTCGCTTCACCTTTTTTTATCCTTTCTCGACGAAAGTTGAATCCTCGCAGAGGATGCGTTTCTTGC...

XR_009093787.1
GTTATTTCTTTAAATCTGTTATGGTTCTATGTTCGTTCGGCTGTTTGATTCGATGGTTATTCTATGGGAATCGTTCGCTAAATTTTCCGCTTCTTTCTGGTTGGCGCTGTAAAGATTGTTCGTCATCTTTTGAGGGTGTGGACAGATAGGGACAGACTTTCTCGGGAAATAATTCAACTTAAAATAAAGGAGCACTCGCTTCACCTTTTTTTATCCTTTCTCGACGAAAGTTGAATCCTCGCAGAGGATGCGTTTCTTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000764
ATGCGTTTCTTGCAAAAGATTCGTCCCGCCCTTACATATCCGCTCTGTAGATGCCTCACACGGCGGCACATGCAACTATTCGTCGGAGGACTCTCTTATGATACCAATGAAAGTGTGCTTAAGGATGCGTTCGAGAACTATGGTGAAATAGTTGAAGTCAAGGTAATATGTGATCGTGTGAGTGGAAAATCAAGAGGATATGGATTTGTGCGCTACTCTTCTGAAGCAGCAGCAAACAAAGCCCTGAAAGAAATGGACGG...

LOC131000764
ATGCCTCACACGGCGGCACATGCAACTATTCGTCGGAGTGTTCGGCTTCCTACAGGACTCTCTTATGATACCAATGAAAGTGTGCTTAAGGATGCGTTCGAGAACTATGGTGAAATAGTTGAAGTCAAGGTAATATGTGATCGTGTGAGTGGAAAATCAAGAGGATATGGATTTGTGCGCTACTCTTCTGAAGCAGCAGCAAACAAAGCCCTGAAAGAAATGGACGGTCTGTTGCTAGATGGTAGGAACATCCGAATTCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782812.1
MPHTAAHATIRRSVRLPTGLSYDTNESVLKDAFENYGEIVEVKVICDRVSGKSRGYGFVRYSSEAAANKALKEMDGLLLDGRNIRIHYAHRGGSKEVRDECSSTSIEDCLKLPTL

XP_057782813.1
MRFLQKIRPALTYPLCRCLTRRHMQLFVGGLSYDTNESVLKDAFENYGEIVEVKVICDRVSGKSRGYGFVRYSSEAAANKALKEMDGLLLDGRNIRIHYAHRGGSKEVRDECSSTSIEDCLKLPTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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