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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001196`

染色体: Chr08 坐标: 9643945-9646278 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001196`
名称	SmilChr08G001196
描述	scarecrow-like protein 33
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9643945 - 9646278 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000782`
GeneID	`131000782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000782`
原始查询	`LOC131000782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 33
产物	scarecrow-like protein 33
Arabidopsis	`AT2G29060` (AT2G29060) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817454] identity=47.3; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0590400` (OsGRAS23) - identity=49.9; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782834.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782834.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782834.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782834.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9644476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:9644573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:9644683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B118,B18
`Chr8:9644855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:9645068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr8:9645205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:9645754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:9645814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C9
`Chr8:9645817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B109,B24,D3
`Chr8:9645829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B93,C13,C29,C43
`Chr8:9645880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B109,B24,D3
`Chr8:9645913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B109,B11,B24,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782834.1

623 aa

312

623

GRAS

PF03514 GRAS 249-619 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782834.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	249	619	1.4e-118	396.9	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926851.1
AGTTATCCATATTTCAGTTTAGTGGGTGGCCCGCTGAGCGCGCATGTCTACTTCCTGCTACCTTCCTCCTCTACTTTCCTTGGTTTATAAAAACCCCTCCGTTCACATTTCTCTTTGAATTCAAACTCCAATTTTCTATATTTGTCGGATTGTTCGAAACCGCGTCAACATTCACTCCTTTTCTTCTTTCTGGTTTGTTTACCTCAATTCTAGCGAAGAAGAAACCCTAAATTTATCTGGAAATCGAGGTGTGATGAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000782
ATGAATACTTTAGTCCAAGGATATATGGCTCCGGCAAACGATTTCCAGCTGAATTGCCGGTCGAGATCAGTTTTCCCCGAAGAAAACCGTGTTTTGGGGCGTAATCAGAACCTCATAAATGGCGACGAATATCCATCTGAAGGGGAAGTTTCCGTTACATCGCAGGATGAAGGGTCGTGTTCATCGCCGGAGGGGGAGCTCTCTAAAGAAATGGATCACTCCGATGCAATTCTCAAGTTCATAGGCATCATGCTCATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782834.1
MNTLVQGYMAPANDFQLNCRSRSVFPEENRVLGRNQNLINGDEYPSEGEVSVTSQDEGSCSSPEGELSKEMDHSDAILKFIGIMLMEEEDLENKPCMLHDCLALQATEKSLYDVLNNNNSDQTDSSSDITSFLESSWSDNMRDFESGSEIQYQSTPPPREKKHRYRDDGGDDYRSNKQLANNVVGGESEPLDIFDKVLLCSNSDADLMSDCRKPDENEAKKKWPQRKGSGRGRPRGGKKQGVIKEVVDLRSLLMQCAQAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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