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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001213`

染色体: Chr08 坐标: 9802287-9805250 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001213`
名称	SmilChr08G001213
描述	uncharacterized SmilChr08G001213
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9802287 - 9805250 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000801`
GeneID	`131000801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000801`
原始查询	`LOC131000801`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TATA box-binding protein associated factor RNA polymerase I subunit C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821360]; symbol=AT3G18310; hit=AT3G18310; species=arabidopsis; confidence=low
产物	TATA box-binding protein associated factor RNA polymerase I subunit C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821360]; symbol=AT3G18310; hit=AT3G18310; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G18310` (AT3G18310) TATA box-binding protein associated factor RNA polymerase I subunit C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821360] identity=33.2; qcov=1.04; evalue=5.12e-115; confidence=low
Rice	`Os03g0240400` - identity=28; qcov=1.06; evalue=1.19e-74; confidence=low
GO	GO:0001164 (RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding); GO:0001650 (fibrillar center); GO:0006360 (transcription by RNA polymerase I)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782867.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782867.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782867.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782867.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9802600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr8:9802890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101
`Chr8:9803086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41
`Chr8:9803087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41
`Chr8:9803106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C82
`Chr8:9803458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,D4
`Chr8:9803472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B48
`Chr8:9803603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C76
`Chr8:9803620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101
`Chr8:9803846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B118,B18
`Chr8:9804147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C34,D11
`Chr8:9804149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926884.1
GGCCCAAAGTGAAAAGAATGTGTGAAATTTAATGGCTGAGGCTCAGCCCATCGTTAGGGTTTAAGAGAATTGCGCGCTCCGACAAAGTTGAACCCGTTTCCGGCTCGAATTCAAATCTTCTTTACCTCTCTCCGGTATTCTTTTCATTGAATTTCTTGATTCTAATATCTGGAGTTCCATTACATCCTTTCACTTGTTGTGCAATCGACAACAAAAACAAAAAAAGAATCATTCGATGATTGATGGAGAATGGAAATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000801
ATGATTGATGGAGAATGGAAATCCCTTTGGCCCATAGGCTCCACCTTCGCTGCTCCATTGCTCATCCCAAACAAAGGAGCGTTTGGCCCGCTGACGTTCAACCCGAGCCCCAGCTTCTCCACCACTATCCATCAATCTCCCTCCCTCGCACCATGCCTCCCCCCGCCATATCCCCAGCTCACACTTTCCCGCTTCCTCCAAGAACACACTGTTCATCCTTCTATTTCCTCTTTTCTCGCTCCCAATTTCTCTTCTGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782867.1
MIDGEWKSLWPIGSTFAAPLLIPNKGAFGPLTFNPSPSFSTTIHQSPSLAPCLPPPYPQLTLSRFLQEHTVHPSISSFLAPNFSSDYHAFNSLQLLQIPHKNLVIAFFPAGDNSDRVGFSLLSIKNGILEVQSLGEHFFRVVEQGNVNCQRITCLLVNPFDDFLMVCTKYSVYWYRVRYENSVSVDYLGSANAKMLMGKSVESGCWSPHISEECLVLLEGGDLVLFDVNQSSGRKANAMLSVSRHNSFISRKLQVPLSNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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