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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001219`

染色体: Chr08 坐标: 9828144-9832190 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001219`
名称	SmilChr08G001219
描述	TPR repeat-containing protein ZIP4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9828144 - 9832190 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000807`
GeneID	`131000807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000807`
原始查询	`LOC131000807`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TPR repeat-containing protein ZIP4
产物	TPR repeat-containing protein ZIP4
Arabidopsis	`AT5G48390` (AtSPO22) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834894] identity=58; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0890900` (OsZIP4) - identity=39.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0051321 (meiotic cell cycle); GO:0090173 (regulation of synaptonemal complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF08631 (SPO22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782875.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057782875.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782875.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782875.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9828458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:9828507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:9828607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C39
`Chr8:9828647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:9828784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C29
`Chr8:9828803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C16
`Chr8:9829438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C34
`Chr8:9829440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C77
`Chr8:9829954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:9830018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B48
`Chr8:9830450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,D4
`Chr8:9830746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782875.1

949 aa

474

949

SPO22

PF08631 SPO22 193-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782875.1`	Pfam	`PF08631`	SPO22	Repeat	193	467	1e-36	127.5	Meiosis protein SPO22/ZIP4 like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926892.1
CGGTTTGTGATAGTTAAAGGGTCCAATCTTATTTTAATATTCCATCCATCCTCATATTATTTATTTAGGTTAGATATATAATTAATCTCATTTTTTCTTATCCTAGTTTTATTAATTACTACATCATTTCTAAGCACGACTGCCAAACACATTAAATAAATCATATACTACAAAAGTATACCGAGTGTAAAATCTCAATGGTTAATGCTTCAAACCAACATTATAATAGTGTTTCATTATCTAGCCTTACATGACACACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000807
ATGAGGATCTCCGAGATCTCCCCCATACAAGATCACCGCCGAGCCTCCGCCACGACCGCCGAAGCCGTCGATACCGACTCCGACCACTCAACCGTGCTCTCGAAGATCGAGTCCACAATCAAATTACTCGAGCGTCACACCCCAGCGCATCCTTTGCCGGATTCATACGCCTCCGAGATCCGACTGCCCGTCGCTCAGCTGAGTCAACTCGCTCCTCTGCCCAATTCCGCCAAGCTTCTCGTTTGGAAACTAAGCTACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782875.1
MRISEISPIQDHRRASATTAEAVDTDSDHSTVLSKIESTIKLLERHTPAHPLPDSYASEIRLPVAQLSQLAPLPNSAKLLVWKLSYRLWNACVDLSNASSRKISEELAKLRQVAAEMLLVTDDVAGIPSPAFKAALFFYKTGLVWYDLRKFDLANTCFEKATDLVSNIEINSVSDDDERKLLLDLNLARSRASWEVSDRNLAIALLNRSKSVLFGVSRNYNALAHQYLSFGKTLLSTSEVSTVNEALKLMNDALELCEKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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