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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001282`

染色体: Chr08 坐标: 10210117-10212185 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001282`
名称	SmilChr08G001282
描述	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10210117 - 10212185 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000835`
GeneID	`131000835`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000835`
原始查询	`LOC131000835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
产物	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
Arabidopsis	`AT2G14960` (GH3.1) Auxin-responsive GH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815985] identity=59.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0592600` (GH3-8) - identity=55.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016881 (acid-amino acid ligase activity)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03321 (GH3); PF23571 (GH3_M); PF23572 (GH3_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000835

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782921.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782921.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782921.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782921.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10210244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A16,A18,A19,B107,B114,B122,B133,B33,B35,B42,B43,B45,B49,B5,B57,B62,B65,B68,B93,B94,C25,C32,C4,C42,C47,C61,C68,D7
`Chr8:10210629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B52,C21,C36,C82
`Chr8:10210677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:10210719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B52,C21,C36,C82
`Chr8:10210753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:10210758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:10210844`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A24,B105,B115,B24,B25,B4,B40,B52,B97,C36,C45,C6,C68,C69,C74,D5
`Chr8:10210846`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	73	A11,A14,A18,A2,A5,B1,B103,B109,B11,B111,B120,B127,B128,B13,B132,B134,B137,B25,B27,B30,B31,B32,B34,B35,B4,B42,B43,B47,B5,B50,B54,B60,B61,B63,B65,B67,B71,B72,B75,B77,B82,B84,B86,B89,B93,B94,B95,B97,C1,C10,C13,C24,C26,C29,C3,C31,C37,C40,C43,C50,C51,C52,C55,C59,C62,C63,C7,C70,C74,C78,C79,D3,D9
`Chr8:10210848`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	67	A11,A14,A2,A5,B1,B103,B109,B11,B111,B120,B127,B128,B13,B132,B134,B137,B25,B27,B30,B31,B32,B35,B42,B43,B45,B47,B5,B50,B54,B60,B61,B63,B65,B67,B71,B72,B75,B77,B82,B84,B86,B89,B93,B95,C1,C10,C13,C24,C26,C3,C31,C37,C40,C43,C50,C51,C52,C55,C59,C62,C63,C7,C70,C78,C79,D3,D9
`Chr8:10210853`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A22,B110,B119,B134,B137,B20,B26,B54,B57,B59,B76,B8,B83,C2,C7,C73,C77
`Chr8:10210857`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A22,B110,B119,B134,B137,B20,B26,B54,B57,B59,B76,B8,B83,C2,C7,C73,C77
`Chr8:10210955`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	203	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B101,B103,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B120,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B139,B18,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B91,B93,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782921.1

585 aa

292

585

GH3

GH3_M

GH3_C

PF03321 GH3 20-327 aa PF23571 GH3_M 355-423 aa PF23572 GH3_C 439-554 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782921.1`	Pfam	`PF03321`	GH3	Domain	20	327	3.1e-104	349.1	GH3 family N-terminal domain
`XP_057782921.1`	Pfam	`PF23571`	GH3_M	Domain	355	423	3.7e-28	98.1	GH3 family central domain
`XP_057782921.1`	Pfam	`PF23572`	GH3_C	Domain	439	554	7.3e-28	98.4	GH3 family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926938.1
CGCATTCTCAATTCCTCCGATCACTATCCTCTCTCTCTCTAGAAATCACGTATCAATGGCGGGCATCTCTTCTTTGTCATCTCCAGTGAACACTCCGGCACATGCTAAGGAACTTGAATTGATCGAAGAAACCACCAAAAATGCTTACGAACTACAAAACTACGCATTAGCACAAATTCTCACCCAAAATGCGCACACTGAATATCTCAAGAACTTCAATCTCGACGGAGCTACCGATCGGAAATCATTCCTATCCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000835
ATGGCGGGCATCTCTTCTTTGTCATCTCCAGTGAACACTCCGGCACATGCTAAGGAACTTGAATTGATCGAAGAAACCACCAAAAATGCTTACGAACTACAAAACTACGCATTAGCACAAATTCTCACCCAAAATGCGCACACTGAATATCTCAAGAACTTCAATCTCGACGGAGCTACCGATCGGAAATCATTCCTATCCAAAGTTCCGATGGTTACCTACGACGATCTTCAGCCGATGATTCAAAGACTAGTCGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782921.1
MAGISSLSSPVNTPAHAKELELIEETTKNAYELQNYALAQILTQNAHTEYLKNFNLDGATDRKSFLSKVPMVTYDDLQPMIQRLVDGDRTPILCALPISEFLSSSGTSSGDPKLFPNHEEETNRRLLLCSLIRPILNKFVKGWEQGKGLYFMFVKPEARTRGGHPIQPGSTGMVRKRDAESRPHDPYYDFTSPTEAMFCTDPFQSMYTQMLCALYERQQVGRVGAQFALGLLRAIRFLQLNWQQLTRDIRTGSLSPNVTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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