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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001267`

染色体: Chr08 坐标: 10063187-10064785 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001267`
名称	SmilChr08G001267
描述	uncharacterized SmilChr08G001267
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10063187 - 10064785 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000852`
GeneID	`131000852`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000852`
原始查询	`LOC131000852`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0009834 (plant-type secondary cell wall biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF29364 (TED6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000852

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057782954.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057782954.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782954.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782954.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10063577`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr8:10063577`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr8:10063579`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr8:10063579`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr8:10063603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:10063867`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B68,C71
`Chr8:10063867`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B68,C71
`Chr8:10063877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:10064086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C39,C76
`Chr8:10064177`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr8:10064177`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr8:10064295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B65,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782954.1

443 aa

222

443

TED6

PF29364 TED6 392-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782954.1`	Pfam	`PF29364`	TED6	Domain	392	423	9.5e-09	35.7	TED6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926971.1
ACATTAATCAATCAATTAATTGATGCACAAACCAACGCCACTACGATTATATAAACACACACACACAACCCCAAAAGGGGAAAAAAGACCAAACAAAATGGCTTCGCTCAGAAGTATGAATAAGATGGCTTATCCATACTCTTCTCCACCACCACCTCCACCATCTCCTCCATGCAGCCCCCCTCCGCCGCCGCCACCACCACCATCTCCTCCATGCAACCCTCCACCTCCACCTCCTCCATGCAACCCTCCGCCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000852
ATGCACAAACCAACGCCACTACGATTATATAAACACACACACACAACCCCAAAAGGGGAAAAAAGACCAAACAAAATGGCTTCGCTCAGAAGTATGAATAAGATGGCTTATCCATACTCTTCTCCACCACCACCTCCACCATCTCCTCCATGCAGCCCCCCTCCGCCGCCGCCACCACCACCATCTCCTCCATGCAACCCTCCACCTCCACCTCCTCCATGCAACCCTCCGCCTCCGCATTCTCCACGATGCCAAGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782954.1
MHKPTPLRLYKHTHTTPKGEKRPNKMASLRSMNKMAYPYSSPPPPPPSPPCSPPPPPPPPPSPPCNPPPPPPPCNPPPPHSPRCQDKKHCGHHKPPTAPSPAPSHNHPPHHHHHHHHHHKPSAPPAPAPAPKPSVPTKPPHTPAAPPKSPPPSSKCPPPPPKSETPSHPPEKPAYPPKTPPHHHPPSPAPKPSVPATPHYPPTNPAPPPDSPPSPSPKPGVPAKPPKPQTPHYPPNGPAAPPKSPPGSSHYPPSPSPKPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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