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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001341`

染色体: Chr08 坐标: 10704333-10706565 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001341`
名称	SmilChr08G001341
描述	la-related protein 6C
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10704333 - 10706565 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000856`
GeneID	`131000856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000856`
原始查询	`LOC131000856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 6C
产物	la-related protein 6C
Arabidopsis	`AT3G19090` (LARP6c) RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821444] identity=43.9; qcov=1.14; evalue=7.05e-118; confidence=medium
Rice	`Os07g0102500` - identity=43.2; qcov=1.07; evalue=6.5e-105; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005844 (GO:0005844); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782960.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782960.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782960.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057782960.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057782960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10704888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C68
`Chr8:10704956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A15,B1,B114,B55,B87,C23,C38,C54,D10
`Chr8:10706104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:10706115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B74,B99,C2,C39
`Chr8:10706203`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr8:10706203`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr8:10706206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782960.1

396 aa

198

396

RRM_1

PF05383 La 113-170 aa PF00076 RRM_1 206-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782960.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	113	170	1.9e-13	50.8	La domain
`XP_057782960.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	206	275	5.6e-08	33.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926977.1
TAAACATACAAATCATTTGAATCAACACTACAATTGAGGAGAAAACAACCAATTTCCCCTCAAATTCCTACAACCACCAATCCCAACCTTACTACAAAACCAACACTCCCAAAATGTGCATGAAGAAGTCGAAGCAAAGCCACAGCTTTGATCCAAAATAATTTATTTACTTTTTTATTTTTTCCCTTTATCTTTTTAACAAAAAGATCATTCTCGTGTAACAAAAAAAAAATTCACAAAAAAAAAGGTTACAAACAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000856
ATGGCGCAAATGAGCGAACAAGATTATGCTCGAGAAAAAGAAGAATCGAAGAGCGAGAGCCGGCGGAGCAGCAGCGGCGGGGCGTTCAAGTTTAACGTGGCGGCGCCGGAGTTCGTGCCGACGATGGTGGCGGCCCCTGCGGCGGCCCAGGTGCCCATAACTGGGTACTTCTACCCGTGCTTCCAGTCGATGGACGGCACGACGGGCAGCTGGATTTACGTGTCCGATCAAGAAATCACGATCCCATTGGTTCAGCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782960.1
MAQMSEQDYAREKEESKSESRRSSSGGAFKFNVAAPEFVPTMVAAPAAAQVPITGYFYPCFQSMDGTTGSWIYVSDQEITIPLVQPKPSAKVASPHIAQPKEAALSEELKQKIIKQAEYMFSDMSMLANETLVKHVNKDPEGYVPINFVSTLKKLKSLNVNNQMVAQALRCSSKLIVSSDGKKVKRKHPFTEKEKEELQLRTVIAENLPDDHSHQKIEKMFNVVGNIKSIRICQPQDHNSSRSSKGDIVISNKLHALVEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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