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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001374`

染色体: Chr08 坐标: 10949366-10953276 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001374`
名称	SmilChr08G001374
描述	pseudouridine kinase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10949366 - 10953276 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000859`
GeneID	`131000859`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000859`
原始查询	`LOC131000859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pseudouridine kinase
产物	pseudouridine kinase
Arabidopsis	`AT1G49350` (AT1G49350) pfkB-like carbohydrate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841358] identity=48.6; qcov=1.01; evalue=9.19e-97; confidence=high
Rice	`Os05g0185700` (OJ1111_A10.13) - identity=46; qcov=0.994; evalue=5.54e-96; confidence=high
GO	GO:0016301 (kinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00294 (PfkB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782963.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057782965.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057782965.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057782963.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10949800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10949952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B126,B54,B55,C2
`Chr8:10949997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D6
`Chr8:10950159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:10950403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:10951845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:10951906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:10951907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:10951927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B138,B15,C1
`Chr8:10952851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:10952891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782963.1

391 aa

196

391

PfkB

PF00294 PfkB 10-259 aa

XP_057782965.1

317 aa

158

317

PfkB

PF00294 PfkB 1-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782963.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	10	259	2.7e-29	103.2	pfkB family carbohydrate kinase
`XP_057782965.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	1	185	9.2e-14	52.2	pfkB family carbohydrate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926980.1
TGCTCAGCCCTAGGCCACGTTATGGGCATCCGAAGTTAGTTTTAGGTAGCTCCTCTGTCTCCATTGCTACCCTCGCCGATCGAATGAGTTAAGCTTTCCGGCGGAAGGATAGACTTCACTCCCGAGAATAATCCTAGCCGCCAAGGTTGGGGTTCCACAGTGAGTAAAATGGGTCGAGGTTTAGATAACGAAGCAGAAGCAGTAGTGATTGGAGGAATGGTACTTGACGTTTATGCCACCCCTTCTACGGCTACTAATCG...

XM_057926982.1
ATTAGGCGGTGTAGCAAGAAATATTGCGGAGTGTATGTCAAAGCTTGGAGCAAAGCCTTACATGATAAGTGCTGTGGGCTTTGACTTGGCAGTTTCATGGCTACTGAAATGTGTCCTCACTTCTGCTGCAACAGTCAGTAATGGAATGCCTTTTTATGACCAGGAAATATGCTCCTGGAACCTTGGAGAGCTGCTGGGTTATCTTTAGAAGGCATCAAGAGAAGCAAGGATATTGATACAGCTACTGTCTGCATCATATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000859
ATGGGTCGAGGTTTAGATAACGAAGCAGAAGCAGTAGTGATTGGAGGAATGGTACTTGACGTTTATGCCACCCCTTCTACGGCTACTAATCGAGGAACCACTGCTCCTGGAAAGGTTCGCTATGCATTAGGCGGTGTAGCAAGAAATATTGCGGAGTGTATGTCAAAGCTTGGAGCAAAGCCTTACATGATAAGTGCTGTGGGCTTTGACTTGGCAGGAAATATGCTCCTGGAACCTTGGAGAGCTGCTGGGTTATCTTT...

LOC131000859
ATGCTCCTGGAACCTTGGAGAGCTGCTGGGTTATCTTTAGAAGGCATCAAGAGAAGCAAGGATATTGATACAGCTACTGTCTGCATCATATTTGATGGTAAAGGAGAACTGGCTGCTGCTGTCGCTGGCGTTGAATCAATTGAAAAGTTTGTTACTCCTGAGTGGATTACAAATTTCAAGATCAACATATGTTCTGCCCCTATAGTGATGGTTGATGCAAATTTAAGTCCTCCTGCTCTTCTGGCTTCTTGCCAAATTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782963.1
MGRGLDNEAEAVVIGGMVLDVYATPSTATNRGTTAPGKVRYALGGVARNIAECMSKLGAKPYMISAVGFDLAGNMLLEPWRAAGLSLEGIKRSKDIDTATVCIIFDGKGELAAAVAGVESIEKFVTPEWITNFKINICSAPIVMVDANLSPPALLASCQIAAECGIPLWFEPVSVVKSKRVASIAKLITYTSPNEDELIAMANALSSGDKFLPVQKDGKTVRTSIKSLFEKLKPAIWVLLEEGIKVVLVTLGSHGVFLCF...

XP_057782965.1
MLLEPWRAAGLSLEGIKRSKDIDTATVCIIFDGKGELAAAVAGVESIEKFVTPEWITNFKINICSAPIVMVDANLSPPALLASCQIAAECGIPLWFEPVSVVKSKRVASIAKLITYTSPNEDELIAMANALSSGDKFLPVQKDGKTVRTSIKSLFEKLKPAIWVLLEEGIKVVLVTLGSHGVFLCFKAIDGVKKRNPCKNSPYSRKLYEAVNLSCPQDGILGTPKSKGNYYVAIHFPALPASVVTLVGAGDCLVGGTLAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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