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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001342`

染色体: Chr08 坐标: 10712980-10714981 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001342`
名称	SmilChr08G001342
描述	transcription factor HHO6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10712980 - 10714981 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000861`
GeneID	`131000861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000861`
原始查询	`LOC131000861`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor HHO6-like
产物	transcription factor HHO6-like
Arabidopsis	`AT2G03500` (AT2G03500) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814878] identity=40.4; qcov=0.888; evalue=1.7e-60; confidence=medium
Rice	`Os03g0764600` (OSJNBa0079B15.28) - identity=37.6; qcov=0.891; evalue=4.84e-53; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF26575 (HHO5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782967.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782967.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782967.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782967.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10713554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C40
`Chr8:10713597`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	126	A1,A10,A14,A16,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A8,B1,B102,B103,B106,B107,B108,B110,B114,B117,B119,B12,B121,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B136,B137,B139,B15,B17,B18,B19,B20,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B36,B38,B39,B42,B45,B47,B48,B5,B50,B53,B56,B57,B59,B60,B63,B64,B67,B68,B69,B70,B71,B74,B75,B79,B8,B81,B83,B87,B90,B93,B94,B95,B97,B98,C11,C18,C19,C24,C25,C28,C30,C31,C33,C35,C4,C40,C41,C42,C47,C48,C49,C53,C54,C55,C57,C59,C6,C62,C69,C71,C72,C73,C76,C82,C83,C84,C85,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:10713776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:10714058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A23,B16,B41,C86
`Chr8:10714344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B16,C86
`Chr8:10714670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782967.1

385 aa

192

385

HHO5_N

Myb_DNA-binding

PF26575 HHO5_N 14-78 aa PF00249 Myb_DNA-binding 245-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782967.1`	Pfam	`PF26575`	HHO5_N	Domain	14	78	7.4e-29	100.3	HHO5-like, N-terminal domain
`XP_057782967.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	245	296	2.1e-07	31.7	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926984.1
CAAAATATTCCCACACTCAGTTTCTCTCACTTAAAATGAGAGAGAGAGAGGGAGAGATGAAATGGGAAGCAAGCAAGACGATAAAATATGCGACGAATTGAAAAAGACTTTTTCCTATTTTCTGATATAATTATCCACTCACAACAGGCATATTAGCCTCACCTCTGTCAAAACTCGGCGTTGTTCAACAGAATCTTCTTGCCCTACTTTCTCTCTCTAAACTCCTTCCGTTCACATTTATATAAAGCATCGCGCACCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000861
ATGGGATCGCAGGGACTCACCTTAGATTGCAGTCCTCCGTCTCCGAAATCCACGGGCGACTTTCTCGCACAAGTTTCCAGGATGGATAGCGTAACCCAGAAGATTTCCAAGCTCGATGATTACGTCAATCGGCTGCAAGATGAGATGAAGAAGATCGATGCTTTCAAGCGCGAGCTACCTCTCTGCATGATCCTCCTAAATGATGCGATTGCGAGAATGAAGGAGGAGATAATGCGATGCCAGAGCTCAAATTGCGAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782967.1
MGSQGLTLDCSPPSPKSTGDFLAQVSRMDSVTQKISKLDDYVNRLQDEMKKIDAFKRELPLCMILLNDAIARMKEEIMRCQSSNCEPILEEFIPLKKSSSDKDEKTGDVKETDIVNRREKMNWMSSVQLWNTDSNKKRKEEAVDQAAMGELFRTGKSSRAAGKALSPFKGCSNFLAMTVGKEGRDEFPGAPSLSLRTPEIKNSTEEIFRNNFSSKSSSSRSGSSCGTNSQSSFKADSQQTGRKQRRCWSPELHRRFVSAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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