Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001332`

染色体: Chr08 坐标: 10652771-10655656 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001332`
名称	SmilChr08G001332
描述	uncharacterized SmilChr08G001332
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10652771 - 10655656 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000873`
GeneID	`131000873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000873`
原始查询	`LOC131000873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816067]; symbol=AT2G15730; hit=AT2G15730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816067]; symbol=AT2G15730; hit=AT2G15730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G15730` (AT2G15730) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816067] identity=68.28; qcov=0.967; evalue=3.24e-176; confidence=high
Rice	`Os03g0394900` - identity=59.64; qcov=0.97; evalue=5.63e-148; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000873

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057782986.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057782987.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057782986.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057782986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10653034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C21,D10
`Chr8:10653042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:10653044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:10653799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:10653901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:10653941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C23,C8
`Chr8:10654748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:10655202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:10655251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C77
`Chr8:10655251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:10655298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:10655310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927003.1
ACAATATCGAAAAGGGAGCGTGGCAACGGTCTTTACAAGCACATCATCATAGTTGTTTTCACGAGAAAAAGTCCAGTCCAGACCTCTGTCCTTCTCTCTCTAGCTATAGATACACATATACGTACACATGCCCATATATATATATATGGCCTGTTGCATGTCGAGAGTCACTAAAGGAAGAAGAAAAATGCTCAAAGCAAAATGGTAAAGACCACCTGTTTAATCTGAGCTGCCCTTTTTAGTCGTAAGCAGAGAACTCA...

XM_057927004.1
GGTCTTTACAAGCACATCATCATAGTTGTTTTCACGAGAAAAAGTCCAGTCCAGACCTCTGTCCTTCTCTCTCTAGCTATAGATACACATATACGTACACATGCCCATATATATATATATGGCCTGTTGCATGTCGAGAGTCACTAAAGGAAGAAGAAAAATGCTCAAAGCAAAATGGTAAAGACCACCTGTTTAATCTGAGCTGCCCTTTTTAGTCGTAAGCAGAGAACTCATGCCAGAGGACCTGGATAGCTTGATGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782986.1_41960
ATGCCAGAGGACCTGGATAGCTTGATGATTATCAAATCTTCTAAGAGAAAACCCCTGGTATTGAGGATGGTGGTTATAATTTTCGCAATGGCATCTGGTATTTACATATGCTCAATCTGTCTTAGGCAAATTGGTGGACATTCAATTGGAAGTTCTATGAGCATTCAAGTTGTACGGAGGCCGTGTGAAGCCACAGATATCGAACCTTATGTCCATTTCCCCAAACCAAAGACTTTCAGCAGGGACGAATGTGCGTGCAA...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782987.1_41961
ATGAGCATTCAAGTTGTACGGAGGCCGTGTGAAGCCACAGATATCGAACCTTATGTCCATTTCCCCAAACCAAAGACTTTCAGCAGGGACGAATGTGCGTGCAATCCTGTACGATACTTTGCAATTTTATCTACGCAGAGGTCTGGGAGCGGATGGTTTGAGACACTGTTGAACAGTCATGTCAACATAAGCTCCAATGGGGAGATATTCTCGGTTAAGGTCCGGAGGAGTAACATATCCACTATAGTAGAGACTTTGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057782986.1
MPEDLDSLMIIKSSKRKPLVLRMVVIIFAMASGIYICSICLRQIGGHSIGSSMSIQVVRRPCEATDIEPYVHFPKPKTFSRDECACNPVRYFAILSTQRSGSGWFETLLNSHVNISSNGEIFSVKVRRSNISTIVETLDRVYNLDWLSSASKNECTAAVGLKWMLNQGLMQHHEQLVEYFNSKGVSAIFLFRRNLLRRMVSILGNSYDQKTKPLNGTHKSHVHSIHEAEMLARYKPTIDTKLLIPNLEQVEDLVMRSLQY...

XP_057782987.1
MSIQVVRRPCEATDIEPYVHFPKPKTFSRDECACNPVRYFAILSTQRSGSGWFETLLNSHVNISSNGEIFSVKVRRSNISTIVETLDRVYNLDWLSSASKNECTAAVGLKWMLNQGLMQHHEQLVEYFNSKGVSAIFLFRRNLLRRMVSILGNSYDQKTKPLNGTHKSHVHSIHEAEMLARYKPTIDTKLLIPNLEQVEDLVMRSLQYLNSTRHIILYYEDIRNNRTKLVDVQEFLKVPQRELSSRQVKIHKGALSSQIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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