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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001257`

染色体: Chr08 坐标: 9963412-9966546 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001257`
名称	SmilChr08G001257
描述	uncharacterized SmilChr08G001257
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9963412 - 9966546 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000881`
GeneID	`131000881`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000881`
原始查询	`LOC131000881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821502]; symbol=AT3G19650; hit=AT3G19650; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	cyclin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821502]; symbol=AT3G19650; hit=AT3G19650; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G19650` (AT3G19650) cyclin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821502] identity=38.4; qcov=1.02; evalue=2.84e-41; confidence=medium
Rice	`Os03g0203000` - identity=36.8; qcov=0.763; evalue=3.52e-26; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0006397 (mRNA processing); GO:0035145 (exon-exon junction complex)
KEGG	-
Pfam	PF09405 (Btz)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000881

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783000.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057783000.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057783000.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783000.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783000.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9963860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B62,D4
`Chr8:9965795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A4,C40
`Chr8:9965997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:9966006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B15,B2,C7,C76
`Chr8:9966060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:9966075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:9966195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B15,B2,C7,C76
`Chr8:9966276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783000.1

317 aa

158

317

Btz

PF09405 Btz 73-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783000.1`	Pfam	`PF09405`	Btz	Domain	73	184	1.3e-08	35.8	CASC3/Barentsz eIF4AIII binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927017.1
CAAAAAGAAAAATTAAAAGAATTAAATTGTACGTCAAAGGACTCAAATGAGTTGGTCAGTGGGATTGGTTTAGGGATTCAAGTGAGTGCAGCTCTTTCACCGCCGCGGCTCAGAACAAAGTGGTGGCGCCGCTTACTCATAGAGTCGAGAGAGCTTTAGTATTATCCAACGCAATCCAATGTCACGTCGAGAAGACCGTAGCTCGGAATCGAAGCGCCACCGTTCGCGCTTCGACCGTGAACCGAGCCCCAAGAGATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000881
ATGTCACGTCGAGAAGACCGTAGCTCGGAATCGAAGCGCCACCGTTCGCGCTTCGACCGTGAACCGAGCCCCAAGAGATCTAGGAGAGATGGTAAACCGGAGACTGAAAAGCCGCCGGGCGAGCCGGACTTGGATAAGGACCGGTCGGACCGGGATCATCGGCACCACCGCCGGCTTCCAGGTCCACCGCCACTTGAATGTGGAAACATGAACAGAGAATCTGAAAGGGGGGCTGATGCACATAAAGCAGTAGCCAAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783000.1
MSRREDRSSESKRHRSRFDREPSPKRSRRDGKPETEKPPGEPDLDKDRSDRDHRHHRRLPGPPPLECGNMNRESERGADAHKAVAKRSSDPTKIPQSRSYFQHDDRNSAGQNGRGFSRRADSERGWWSDPKEQRNDKSTDKTASIDAQLKDEKSKDNREGSHVWRHDGYFEMEGNQKPPTRRRPSFREQKIPADPDKSSKAAGDPVLPNPQDHAIDGGRRNDRGHNSRFSDRPERPVAGGRELNKAQSWRGNFSSGDRFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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