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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004272`

染色体: Chr01 坐标: 60965293-60968483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004272`
名称	SmilChr01G004272
描述	uncharacterized SmilChr01G004272
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60965293 - 60968483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000895`
GeneID	`131000895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000895`
原始查询	`LOC131000895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818808]; symbol=AT2G42080; hit=AT2G42080; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818808]; symbol=AT2G42080; hit=AT2G42080; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G42080` (AT2G42080) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818808] identity=41.5; qcov=1.02; evalue=3.39e-55; confidence=medium
Rice	`Os07g0470800` (OsDjC59) - identity=42.7; qcov=0.936; evalue=2.21e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057783022.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057783022.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783022.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783022.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60965523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B136,B16
`Chr1:60965943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C31
`Chr1:60967224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:60967256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:60967722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:60967879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783022.1

265 aa

132

265

DnaJ

PF00226 DnaJ 216-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783022.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	216	261	6.8e-11	42.8	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927039.1
GGGGATCGTGAAATGCCCATTTACAAAATACAACCCAAATGTTCTTCTCTTCACAAAATACAACCAAGATGACCCGGCCCGTTTCCACAGAGTCTTCCGAGTTGACTCACTCATTTGTGAATCGCCCTTTTTTTCAGGGTCGCCACTCCCCAACGCCATAAAAACGAAAGGAGAAAACCAGAGAAAATTCACATTTTTCTTATCAATGATATTAGAGAATGAATAAATCCGGCAGAATAGCGGCGGCGATCAATTCGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000895
ATGAATAAATCCGGCAGAATAGCGGCGGCGATCAATTCGCAAGCCAACCCTTTTCAGCTCAGAGCTTGCCTTTTTCACAGCACTCCTGTTTCCGAGCGCAAAAGGCGCACCCATTGGGATCCCGTCAGCTTTGTTAGGGGTTCCCCAAAGAAATTTAACCAGTATCAGAGAAGGCTCAAGAAAAAGACTTTGTGGCGGGATGTCCATGAATTTGCAGAGAACATATTTCAGAGCTGGGATACGGAAAGGGATAAGCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783022.1
MNKSGRIAAAINSQANPFQLRACLFHSTPVSERKRRTHWDPVSFVRGSPKKFNQYQRRLKKKTLWRDVHEFAENIFQSWDTERDKHEQPGRRNSWFRPNFRDNESNRGRSRYRASQFRRRFEFCDDNDDGGVEYDMFHSMFGGKRSFYWSSTIDDDEPHFSRSSAYSSNYRTSSGRTYQFGDEYEEYYTSQQYERPVDGLRTDRLALGLSPAGPLKIDDVKSAYRACALKWHPDRHQGSSKVVAEEKFKVCSAAYQSLCD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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