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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001373`

染色体: Chr08 坐标: 10946882-10948270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001373`
名称	SmilChr08G001373
描述	probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10946882 - 10948270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000896`
GeneID	`131000896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000896`
原始查询	`LOC131000896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 2
产物	probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 2
Arabidopsis	`AT4G36750` (AT4G36750) Quinone reductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829828] identity=56.9; qcov=1.14; evalue=1.78e-105; confidence=high
Rice	`Os10g0436800` - identity=63.5; qcov=1.02; evalue=2.3e-89; confidence=high
GO	GO:0003955 (NAD(P)H dehydrogenase (quinone) activity); GO:0010181 (FMN binding)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00258 (Flavodoxin_1); PF03358 (FMN_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783018.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783018.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783018.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783018.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783018.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10947130`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:10947130`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10947140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10947152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:10947427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B133,C25,C47
`Chr8:10947427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C25,C47
`Chr8:10947429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:10947431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:10947446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,B70,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783018.1

243 aa

122

243

Flavodoxin_1

FMN_red

PF00258 Flavodoxin_1 46-178 aa PF03358 FMN_red 56-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783018.1`	Pfam	`PF00258`	Flavodoxin_1	Domain	46	178	7.5e-10	39.9	Flavodoxin
`XP_057783018.1`	Pfam	`PF03358`	FMN_red	Domain	56	185	5.2e-12	46.3	NADPH-dependent FMN reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927035.1
TTTGGTGGGGGCTAATAACTATTTCTCAGAAACCAAAATAATCTAAATATACAACAGTTTGACCGTTTATTGCCAGCAAAGCCCCAAACTAGAAGATTCTACGAAATTTCAGTGCATCTAACTTTCCAATTTCTTACAGGTCAGACTAAGCACTCTTTCTACTTTTGCAAACCCAAAATAAAAAAAAATACGATTTTAAACTAGAATCCTCACAATACATGTTTGCAGCTCGTATTCACCCAATATGTATAGTTGGAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000896
ATGGGTAAAGGAGGAGGGTGCATACCAAGCAAACACAAGGCATCTGCGGCAATACCCAATCAAACTGCAGCCCTTTCAGTGAGCGAAAGATCCATCTCATTTGAAGGTCAAAGCCCAAGAAAGTTGAGAATCTTGATCGTCTTCTATTCAATGTACGGCCATGTAGAGGCCCTTGCGAGGGAGATGAAGGAAGGTGTTGATGAGGTTGAAGGCGTGGAGGGGGTCTTGTATCGGATTCCGGAGACATTGGCACCGCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783018.1
MGKGGGCIPSKHKASAAIPNQTAALSVSERSISFEGQSPRKLRILIVFYSMYGHVEALAREMKEGVDEVEGVEGVLYRIPETLAPQALEQMQVPPKDDGIPVISAEQLVEADGLLFGFPARYGSMAAQMKAFFDSTGALWRDQKLAGVPAGFFVGTGTQGGGQETTAWTAITQLAHHGMVYVPIGYTFEEGMWESERIRGGSPYGAGVISGDGTTGGPSQTELALAHHQAKYMASIVKRFAIP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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