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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001286`

染色体: Chr08 坐标: 10244952-10254038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001286`
名称	SmilChr08G001286
描述	transcription factor bHLH113
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10244952 - 10254038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000898`
GeneID	`131000898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000898`
原始查询	`LOC131000898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH113
产物	transcription factor bHLH113
Arabidopsis	`AT3G19500` (AT3G19500) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821484] identity=43.9; qcov=0.794; evalue=9.62e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0493100` (OsbHLH065) - identity=43.1; qcov=0.5; evalue=1.14e-18; confidence=low
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783020.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783020.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783020.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783020.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10245483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B34
`Chr8:10253099`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C16
`Chr8:10253099`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C16
`Chr8:10253139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927038.1
TGGCTTTGGAAGTTTGACTGTGAGACGACGACAATACCGAAGCCCCTCATCTTGCTGTCGCCTCATCTTCCTCCTTCAAATGCTGTATAGAGAGAGAAAGAGCCACCATTGTTTCTAGAGAGAGACTACTATACTACTACTATTGTTTGAAAAACACAACACATTAATAGAGGATAGCCTAGCTATAGCTACCCAGATATGTATGTATGTATGTATGTATATATATATATAGGCCTCCGTGTTTTCCTTTGGTTTTCTCT...

XM_057927037.1
GGCTTTGGAAGTTTGACTGTGAGACGACGACAATACCGAAGCCCCTCATCTTGCTGTCGCCTCATCTTCCTCCTTCAAATGCTGTATAGAGAGAGAAAGAGCCACCATTGTTTCTAGAGAGAGACTACTATACTACTACTATTGTTTGAAAAACACAACACATTAATAGAGGATAGCCTAGCTATAGCTACCCAGATATGTATGTATGTATGTATGTATATATATATATAGGCCTCCGTGTTTTCCTTTGGTTTTCTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000898
ATGGCGGGTAATACCGGGTTCGGGGATGACCCGTTAGCTCCCGGGTGCTACTCTCAGCTTCTTTTCAGCGATGAGGTTTCCGGTCTGGAAACGGATGGCTGCTTCGGCTTAACTTCTTCCTTCTCGTCTGATGATAATAACAACGCTCCCAAAATGCTGTGTTTTGGTGATTACGCCAATGCCAAGCACAAACCCGGACTCGCATGCATGCCCGATCCTCCACCCAAAAATATCAATAAGAAGAGAAACGGGTCGGGTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783020.1
MAGNTGFGDDPLAPGCYSQLLFSDEVSGLETDGCFGLTSSFSSDDNNNAPKMLCFGDYANAKHKPGLACMPDPPPKNINKKRNGSGTRSAGGCRGAPTGIQRNGKKAKSENSTGGHAKVVKKEKLGERITALQQLVSPFGKTDTASVLHEALGYIRFLHDQVQVLCSPYLQRSSPSSSDAPHSCVSLGDEIDSKNSSSSDLRSRGLCLVPVDLTLHVAESNGADLWSSAPMLNTVSPT

XP_057783021.1
MAGNTGFGDDPLAPGCYSQLLFSDEVSGLETDGCFGLTSSFSSDDNNNAPKMLCFGDYANAKHKPGLACMPDPPPKNINKKRNGSGTRSAGGCRGAPTGIQRNGKKAKSENSTGGHAKVVKKEKLGERITALQQLVSPFGKVQVLCSPYLQRSSPSSSDAPHSCVSLGDEIDSKNSSSSDLRSRGLCLVPVDLTLHVAESNGADLWSSAPMLNTVSPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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