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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001376`

染色体: Chr08 坐标: 10971759-10972731 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001376`
名称	SmilChr08G001376
描述	uncharacterized SmilChr08G001376
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10971759 - 10972731 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000900`
GeneID	`131000900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000900`
原始查询	`LOC131000900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841356]; symbol=AT1G49330; hit=AT1G49330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841356]; symbol=AT1G49330; hit=AT1G49330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G49330` (AT1G49330) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841356] identity=53.01; qcov=0.706; evalue=4.36e-61; confidence=high
Rice	`Os01g0693100` - identity=42.86; qcov=0.877; evalue=8.42e-54; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23324 (DUF7086)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000900

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10972234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C11,C50,C69
`Chr8:10972393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:10972396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:10972423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:10972468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10972504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783025.1

235 aa

118

235

DUF7086

PF23324 DUF7086 94-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783025.1`	Pfam	`PF23324`	DUF7086	Domain	94	227	4.3e-65	218.4	Domain of unknown function (DUF7086)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927042.1
AACAAACTTTCAACCCCATTTCTTCTCAACTCTCTCTCTCGCTTCTCTCACTCCACAAACTGCGAAAGAATGGACACCGACGATAATGGAGTGAACAGAAAGAGAAAGCACGACTTCTTAACCCTGACTCTCGCCGCCGCGGCCGGTACCTCACCGCCACCGCCGCCGCCGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCCACGAATCATGATGCCCCCGTCGGAGACGCCGCCCACCCTCTACCAGCGCCGGCGACCGAGGCGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783025.1_42025
ATGGACACCGACGATAATGGAGTGAACAGAAAGAGAAAGCACGACTTCTTAACCCTGACTCTCGCCGCCGCGGCCGGTACCTCACCGCCACCGCCGCCGCCGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCCACGAATCATGATGCCCCCGTCGGAGACGCCGCCCACCCTCTACCAGCGCCGGCGACCGAGGCGGAAGCCCTCCCGGATGCCGGCGGCGGGGAAGAGCGCGACAATTCCGCCGCCGTATCCGTGGGCGGACGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783025.1
MDTDDNGVNRKRKHDFLTLTLAAAAGTSPPPPPPQQQQQQQPRIMMPPSETPPTLYQRRRPRRKPSRMPAAGKSATIPPPYPWADEGRATVRSLSYLRENGITAIHGDVQCRKCEQKFMMEFDLEQKFGEISTYVAEKKAGMRHRAPNMWRNPALPRCGFCNHEGSVKPVISDKKRSINWLFLFLGQMLGCCTLEQLKYFCKHTKNHRTGAKDRVLFLAYLGLCRQLDPNGPFDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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