当前解析结果
SmilChr08G001330| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001330 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001330 |
| 描述 | cyclin-dependent kinase inhibitor 7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 10634407 - 10636056 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000912 |
|---|---|
| GeneID | 131000912 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000912 |
| 原始查询 | LOC131000912 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cyclin-dependent kinase inhibitor 7-like |
| 产物 | cyclin-dependent kinase inhibitor 7-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0004861 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045736 (negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02234 (CDI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000912 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783040.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057783040.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057783042.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057783040.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783042.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:10634978 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr8:10634980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr8:10634991 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,C52 |
Chr8:10635015 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr8:10635493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783040.1PF02234
CDI 133-176 aa
XP_057783041.1PF02234
CDI 132-175 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783040.1 |
Pfam | PF02234 |
CDI | Family | 133 | 176 | 2.6e-15 | 57.0 | Cyclin-dependent kinase inhibitor |
XP_057783041.1 |
Pfam | PF02234 |
CDI | Family | 132 | 175 | 2.6e-15 | 57.0 | Cyclin-dependent kinase inhibitor |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。