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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001338`

染色体: Chr08 坐标: 10690833-10691787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001338`
名称	SmilChr08G001338
描述	uncharacterized SmilChr08G001338
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10690833 - 10691787 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000917`
GeneID	`131000917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000917`
原始查询	`LOC131000917`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816073]; symbol=AT2G15780; hit=AT2G15780; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816073]; symbol=AT2G15780; hit=AT2G15780; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G15780` (AT2G15780) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816073] identity=52.7; qcov=0.799; evalue=5.59e-44; confidence=medium
Rice	`Os06g0216700` (OsSCL3) - identity=50; qcov=0.707; evalue=4.25e-42; confidence=medium
GO	GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057783047.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057783047.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057783047.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783047.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783047.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10691011`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr8:10691011`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B32
`Chr8:10691041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101
`Chr8:10691130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D11
`Chr8:10691292`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A13,A4,B103,B138
`Chr8:10691292`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A13,A4,B103,B138
`Chr8:10691362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B115,B24,C45,C80
`Chr8:10691458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783047.1

164 aa

164

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 56-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783047.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	56	150	6.3e-05	23.6	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927064.1
GGGGGATTACAACTTGCACTCATACGCGGTAACTACCTAATTTATCTCTCTATATAAACCCTAAAACACCTTCCTTGAAACACCACGATTTCCTATAAACATTTCGAAAAAAGGAAAGAAAATGGGTGTGAAATGCGAAGGAGCATTTGTTCTTATTGTTATTGCATCGATGTTTGCAGCGGGTGCAGCAAACAAGGAGTGGAGCAGCGTGGCCGGAAACTGGAACCACAGCCACAGCCATCCAAATGCAACTTCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000917
ATGGGTGTGAAATGCGAAGGAGCATTTGTTCTTATTGTTATTGCATCGATGTTTGCAGCGGGTGCAGCAAACAAGGAGTGGAGCAGCGTGGCCGGAAACTGGAACCACAGCCACAGCCATCCAAATGCAACTTCCAACAGGTTCATAGTCGGTGGCTCCGAAAACTGGCATTTCGGCTTCAACTACACTAAGTGGGCCATCAACACCGCTCCCTTCTTCCTCAATGACACCTTAGTGTTCAAGTACGACCCACCAAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783047.1
MGVKCEGAFVLIVIASMFAAGAANKEWSSVAGNWNHSHSHPNATSNRFIVGGSENWHFGFNYTKWAINTAPFFLNDTLVFKYDPPNDTTFPHSVYLLPDFWSFKNCDLRRARKIGEVSAGGGDGFEFVLKRWQPYYFACGEHGGAHCKDGLMKFAVWPLIRWFY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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