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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001273`

染色体: Chr08 坐标: 10145859-10147993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001273`
名称	SmilChr08G001273
描述	uncharacterized SmilChr08G001273
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10145859 - 10147993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000918`
GeneID	`131000918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000918`
原始查询	`LOC131000918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815971]; symbol=AT2G14825; hit=AT2G14825; species=arabidopsis; confidence=high
产物	histone deacetylase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815971]; symbol=AT2G14825; hit=AT2G14825; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G14825` (AT2G14825) histone deacetylase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815971] identity=66.4; qcov=0.894; evalue=2.74e-62; confidence=high
Rice	`Os12g0508266` - identity=55.6; qcov=0.887; evalue=6.37e-57; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF02148 (zf-UBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783048.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783048.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783048.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057783048.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10147630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783048.1

160 aa

160

zf-UBP

PF02148 zf-UBP 58-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783048.1`	Pfam	`PF02148`	zf-UBP	Domain	58	117	4.9e-18	65.9	Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927065.1
ATATAGAAGTTAGAAACATCAATACTATGAAACAAAAATATAATATGACGTGTGCGACTGTGCGTGTGTTGATTTAGGGGTAGGTCGTTAATGTTCAAGGCCTGAGGTCCTAAGTTCGAGTCCACCGTCGTGCGATCTTTAAATTTATTTATTTTATAATTAGTCGAATTCTATAGTTTAAAAAAAATAAAACAAATAAAAAAGAAGATAAAGAAAGAATAAAAAGAAAATACTCCATAATTTATAAATAAATTTTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000918
ATGGCGCAAGAGGCTTCTTCTGCATCGTCGTCCTCTCTGACGATGGTTGAAGTAGACGAAGAGTTGATATTGAACGGGTCGGAATCTGGGTGGGTGGAGGCTCGAACTCACTGCGAACATCTCGCTTCCTTGTCGTCCGATCTCATACACATTCCGACCCCCGATACTCCCTGCCACAGGTGTCAGCATCCAGATGAGAACTGGCTATGCTTATGCTGTAAGGATGTTCTCTGCAGCCGATTTGTGAACAAGCACATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783048.1
MAQEASSASSSSLTMVEVDEELILNGSESGWVEARTHCEHLASLSSDLIHIPTPDTPCHRCQHPDENWLCLCCKDVLCSRFVNKHMLEHYQQKSHNLALSYSDLSVWCFSCDAYLDAQVIQPLRAAYETAYILKFGSAPPFRAIEPVQNVGTEANASTGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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