当前解析结果
SmilChr08G001281| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001281 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001281 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001281 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 10207058 - 10207784 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000932 |
|---|---|
| GeneID | 131000932 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000932 |
| 原始查询 | LOC131000932 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0611300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0611300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0611300- identity=45.5; qcov=0.934; evalue=4.25e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000932 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783069.1 |
| 2 | Nucleolus | 核仁 | 1.00000 | XP_057783069.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783069.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783069.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783069.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:10207242 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,C44 |
Chr8:10207246 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C44 |
Chr8:10207246 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr8:10207260 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,C44 |
Chr8:10207280 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C30 |
Chr8:10207294 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr8:10207295 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr8:10207339 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B57 |
Chr8:10207365 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B40,C49,C62,C73,D11 |
Chr8:10207384 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,B51,B91,C49 |
Chr8:10207408 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr8:10207413 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B91,C49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。