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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001404`

染色体: Chr08 坐标: 11252545-11261422 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001404`
名称	SmilChr08G001404
描述	AP-3 complex subunit sigma
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11252545 - 11261422 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000954`
GeneID	`131000954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000954`
原始查询	`LOC131000954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-3 complex subunit sigma
产物	AP-3 complex subunit sigma
Arabidopsis	`AT3G50860` (AT3G50860) Clathrin adaptor complex small chain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824250] identity=65.7; qcov=1.02; evalue=7.02e-80; confidence=high
Rice	`Os03g0228400` - identity=65; qcov=0.963; evalue=2.21e-76; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0030117 (membrane coat); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783090.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057783091.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057783091.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057783090.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057783090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11254353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:11255766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C62
`Chr8:11255793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11255818`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A3,B131,B136,B40,B42,B88,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783090.1

165 aa

165

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 1-143 aa

XP_057783091.1

163 aa

163

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 1-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783090.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	1	143	6.3e-46	156.6	Clathrin adaptor complex small chain
`XP_057783091.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	1	145	4.9e-46	156.9	Clathrin adaptor complex small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927108.1
GGTTTTTAAATTTCGAGAGACCGAGTAGCAAATGAGTACAACTTTGCTTATAAATATAGGAGTACTACAATTATTCACCTGAATTGGGGTTTTGCTTTCTCACTATGATTTTAAGAAACAAAAATTCATATGTAAATCACCACTCTGTAAACACGACTTTGTCTTCATCCGGCTCATACACAAAACAGCAGTGAAGTCGCACAATAAGCTGCACAAAATTGGTCACGAAAATGATACGAGGAGTGATCGTGATGAACGAT...

XM_057927107.1
GGGGTTTTGCTTTCTCACTATGATTTTAAGAAACAAAAATTCATATGTAAATCACCACTCTGTAAACACGACTTTGTCTTCATCCGGCTCATACACAAAACAGCAGTGAAGTCGCACAATAAGCTGCACAAAATTGGTCACGAAAATGATACGAGGAGTGATCGTGATGAACGATCAAGGCAAGCCTCGCCTCATCAAATTCTATGAATTTCAGCCGCCGGAGAAGCAGCAGGAGCTGGTTCGGAGCATTTACAGAATTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000954
ATGATACGAGGAGTGATCGTGATGAACGATCAAGGCAAGCCTCGCCTCATCAAATTCTATGAATTTCAGCCGCCGGAGAAGCAGCAGGAGCTGGTTCGGAGCATTTACAGAATTTTGTGCAGTAGAGCAGAGAACGTCAGTAATTTCGTTAAAGCGGATTCGCTTTTCGGGCCGGATGTACGGCTTGTTTATAAAACTTTTGCAACATTGTACTTTGTCTTCATATTCGATAAATCCGAAAATGAGCTTGCAATGATAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783090.1
MIRGVIVMNDQGKPRLIKFYEFQPPEKQQELVRSIYRILCSRAENVSNFVKADSLFGPDVRLVYKTFATLYFVFIFDKSENELAMIDLMQVFVETLNKCFREVCELDIVFNFYKVHMILDEIILGGQVLETSSEEVANAVDAISRSLSLSLSLSLCSCERRPQVQ

XP_057783091.1
MIRGVIVMNDQGKPRLIKFYEFQPPEKQQELVRSIYRILCSRAENVSNFVKADSLFGPDVRLVYKTFATLYFVFIFDKSENELAMIDLMQVFVETLNKCFREVCELDIVFNFYKVHMILDEIILGGQVLETSSEEVANAVDAISRLEKNANSMIPSIPGWQGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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