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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001418`

染色体: Chr08 坐标: 11350169-11351704 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001418`
名称	SmilChr08G001418
描述	organ-specific protein S2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11350169 - 11351704 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000965`
GeneID	`131000965`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000965`
原始查询	`LOC131000965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organ-specific protein S2-like
产物	organ-specific protein S2-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10950 (Organ_specific)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000965

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057783099.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057783099.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783099.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783099.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11350429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C82
`Chr8:11350521`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:11350521`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:11350551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:11350576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:11350579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B71,B92,D5
`Chr8:11350595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:11350596`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A11,A14,A5,B140,B28,B34,B79,B83,B91,C20,C25,C37,C43,C52,C53,C54,C63,C70,C83,D9
`Chr8:11350599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B50,B67,B7,C82
`Chr8:11350629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B69,C5,C79
`Chr8:11350630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B69,C5,C79
`Chr8:11350695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783099.1

161 aa

161

Organ_specific

PF10950 Organ_specific 27-101 aa PF10950 Organ_specific 104-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783099.1`	Pfam	`PF10950`	Organ_specific	Family	27	101	4.6e-26	92.6	Organ specific protein
`XP_057783099.1`	Pfam	`PF10950`	Organ_specific	Family	104	153	4.6e-26	92.6	Organ specific protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927116.1
TAGTATCAAATTGAAGGGAGAGAGAAAGAGGGAGTATGAGAGCTATGAGATCCCTTTGCTTTGTCGCCACTGTGGCCTTGTGTCTTGCTCTGCTTGCACAAGTTAACGAAGCAAGAAAAGATCTAGAGCAGCATGTCACCGAAGAAAAGAGCGATTGTCACACCTCTATCGAGTCATCCAACCTTGAGGCTGATGGTCACAATCCCGCAAGTGAAAAGTCTTTTATAAGAGATTTTGAACCGAGGCCGAGTGCTACCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000965
ATGAGAGCTATGAGATCCCTTTGCTTTGTCGCCACTGTGGCCTTGTGTCTTGCTCTGCTTGCACAAGTTAACGAAGCAAGAAAAGATCTAGAGCAGCATGTCACCGAAGAAAAGAGCGATTGTCACACCTCTATCGAGTCATCCAACCTTGAGGCTGATGGTCACAATCCCGCAAGTGAAAAGTCTTTTATAAGAGATTTTGAACCGAGGCCGAGTGCTACCGCCTACGTGGATGGTCACAAGCTTACTGGTGAAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783099.1
MRAMRSLCFVATVALCLALLAQVNEARKDLEQHVTEEKSDCHTSIESSNLEADGHNPASEKSFIRDFEPRPSATAYVDGHKLTGEKSFVRDFEPRPSATAYVDGHKLTGEKSFVAKDFESKPNIFKYIDDMNSKNEKVYAKDFEPIPNISAYNDDVVGVGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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