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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001428`

染色体: Chr08 坐标: 11442415-11444085 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001428`
名称	SmilChr08G001428
描述	40S ribosomal protein S25-2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11442415 - 11444085 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000977`
GeneID	`131000977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000977`
原始查询	`LOC131000977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S25-2
产物	40S ribosomal protein S25-2
Arabidopsis	`AT2G21580` (AT2G21580) Ribosomal protein S25 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816696] identity=91.7; qcov=1; evalue=1.08e-55; confidence=high
Rice	`Os08g0559200` (RPS25) - identity=87; qcov=1; evalue=8.73e-51; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03297 (Ribosomal_S25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783112.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783112.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783112.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783112.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11442743`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	72	A11,A21,A22,A24,A4,A5,A7,B1,B10,B100,B102,B107,B109,B114,B12,B124,B127,B128,B130,B136,B139,B16,B18,B19,B2,B22,B30,B34,B36,B4,B41,B45,B49,B50,B54,B55,B57,B59,B61,B63,B67,B72,B73,B76,B8,B80,B85,B86,B87,B90,B91,B92,C11,C20,C21,C31,C33,C35,C41,C50,C55,C57,C6,C60,C62,C64,C66,C70,C76,C79,C82,D4
`Chr8:11442761`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B138,B68,B78,C27
`Chr8:11442761`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B138,B68,B78,C27
`Chr8:11442946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:11442995`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	106	A10,A11,A13,A15,A2,A23,A4,A7,A9,B1,B10,B100,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B12,B121,B123,B124,B128,B130,B133,B136,B137,B139,B14,B16,B18,B2,B20,B22,B23,B29,B3,B32,B4,B40,B41,B44,B45,B49,B50,B52,B54,B56,B57,B65,B66,B69,B7,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B82,B86,B87,B89,B91,B92,B98,B99,C1,C13,C16,C17,C19,C23,C25,C26,C29,C31,C33,C34,C37,C43,C47,C48,C50,C57,C58,C59,C6,C61,C64,C66,C67,C70,C71,C72,C73,C76,C78,C80,C86,C9,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783112.1

108 aa

108

Ribosomal_S25

PF03297 Ribosomal_S25 7-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783112.1`	Pfam	`PF03297`	Ribosomal_S25	Family	7	105	7e-42	142.5	S25 ribosomal protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927129.1
TACTGGAAATAGTGGGCTGGTTAAAGCCCATTAAGAATTTTTGGCGGCCCACCTCTAACCCTAACTCTGTTAGGGGGTGTTTACAAATAAAACCCTAACTACTTCCCGCAAAGCCAAATCCGTCTCTTCGTACTCGCCTTCTCTGCAGATTTCCGCCGCCGCCTCACACACGCTGCGCAACCACCTCAGCCATGGCGCCGAAAAAAGACAAGGCTCCCCCGCCGTCATCGAAGCCGGCGAAGTCCGGCGGAGGCAAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000977
ATGGCGCCGAAAAAAGACAAGGCTCCCCCGCCGTCATCGAAGCCGGCGAAGTCCGGCGGAGGCAAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAAAAGGTGAACAACATGGTTTTGTTCGATAAGGGTACGTACGATAAGCTGCTGACAGAGGCGCCCAAGTACAAGCTCATCACTCCATCCGTTCTCTCTGATCGTCTCAGGATAAGTGGATCCCTTGCAAGGAAGGCCATCAGAGAATTGATGGCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783112.1
MAPKKDKAPPPSSKPAKSGGGKQKKKKWSKGKQKEKVNNMVLFDKGTYDKLLTEAPKYKLITPSVLSDRLRISGSLARKAIRELMARGLIRMVSAHASQQIYTRATNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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