当前解析结果
SmilChr08G001441| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001441 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001441 |
| 描述 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14-1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 11559526 - 11561733 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000992 |
|---|---|
| GeneID | 131000992 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000992 |
| 原始查询 | LOC131000992 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14-1-like |
| 产物 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14-1-like |
| Arabidopsis | AT2G35795 (AT2G35795)Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818152] identity=76.1; qcov=1; evalue=2.95e-61; confidence=high |
| Rice | Os07g0192300 (OsDjC58)- identity=79.7; qcov=1; evalue=2.58e-63; confidence=high |
| GO | GO:0001405 (PAM complex, Tim23 associated import motor); GO:0001671 (ATPase activator activity); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF30912 (TIM141_C); PF30914 (TIM14_N_euk) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000992 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057783127.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057783127.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.80000 | XP_057783127.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783127.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783127.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:11559955 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B77,C19 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783127.1PF30914
TIM14_N_euk 3-29 aa
PF30912
TIM141_C 38-113 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783127.1 |
Pfam | PF30914 |
TIM14_N_euk | Domain | 3 | 29 | 2.8e-15 | 56.4 | TIM14 N-terminal transmembrane region |
XP_057783127.1 |
Pfam | PF30912 |
TIM141_C | Domain | 38 | 113 | 7.7e-44 | 148.3 | TIM14 C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。