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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001452`

染色体: Chr08 坐标: 11688946-11692857 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001452`
名称	SmilChr08G001452
描述	uncharacterized SmilChr08G001452
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11688946 - 11692857 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001000`
GeneID	`131001000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001000`
原始查询	`LOC131001000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203]; symbol=AT5G41980; hit=AT5G41980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203]; symbol=AT5G41980; hit=AT5G41980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=45.5; qcov=0.916; evalue=3.65e-100; confidence=high
Rice	`Os07g0116050` - identity=42.4; qcov=0.921; evalue=3.91e-95; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783138.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057783138.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057783138.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783138.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11691171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:11691386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C31
`Chr8:11691608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:11691727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B4,B53,B76,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783138.1

405 aa

202

405

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 51-142 aa PF13359 DDE_Tnp_4 177-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783138.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	51	142	1.3e-38	131.5	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057783138.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	177	340	2.4e-20	73.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093837.1
TGGATCCAATCCGGATATCAGTCTCGGGTGTAGGGACCCGTTTAGCCAGGGTCCGGAAAGGCAAAAATGGTTCTTATTCTCCGTTTCGTTCTTCCGCCTAACGCTCGCCCATCTTGTCCGCCGTCGTCCGCTCAGAGCACCACCGTCCTCCGCCGCTGGGAGTGAGGACTTTCACCACTGAACCGGGATAAACTCTCATTTGTCAAAATTATACGCCCTATCTTCATTAGGTCACAGTTAGAGAAGTCATTAGCCTACAT...

XR_009093838.1
TGGATCCAATCCGGATATCAGTCTCGGGTGTAGGGACCCGTTTAGCCAGGGTCCGGAAAGGCAAAAATGGTTCTTATTCTCCGTTTCGTTCTTCCGCCTAACGCTCGCCCATCTTGTCCGCCGTCGTCCGCTCAGAGCACCACCGTCCTCCGCCGCTGGGAGTGAGGACTTTCACCACTGAACCGGGATAAACTCTCATTTGTCAAAATTATACGCCCTATCTTCATTAGGTCACAGTTAGAGAAGTCATTAGCCTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001000
ATGACTGGAGCATTGGATCAAATGCACGAATCATCAATCAGTATGGACGACTTCGACATTGAACTAGATGAGATGGAATTAGTTGCAGTAGCTGCAGGTTACCATTATTATAATAGCCTTACAAGGCAGCCAGCTCGTAGCTTGTCACCAAAAGGATCAGGTTTCATGGCTGATGTACTGAATGGCTCTGATGATTTATGTCGGGAAATGTTTAGGATGGACAAACATGTCTTTCATAAATTGAGTGATACTCTTCGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783138.1
MTGALDQMHESSISMDDFDIELDEMELVAVAAGYHYYNSLTRQPARSLSPKGSGFMADVLNGSDDLCREMFRMDKHVFHKLSDTLRQRGMLRDTAGVMIEEQLAIFLNIVGHNERNRVIQERFQHSGETISRHFNNVLKAIKSLSREFLQPPSLATPSEILKSNRFYPYFEDCVGVIDGMHIPAHVPAKDQTRFRNRRGILSQNVLVACTFDLHFIFVYPGWEGSVADSRVLRAVLSDPDQNFPKVPEGKYYLVDLGYDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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