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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001455`

染色体: Chr08 坐标: 11716593-11720050 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001455`
名称	SmilChr08G001455
描述	epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11716593 - 11720050 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001004`
GeneID	`131001004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001004`
原始查询	`LOC131001004`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic
产物	epimerase family protein SDR39U1 homolog%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G21280` (SULA) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816667] identity=79.8; qcov=0.908; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0834700` (P0264G11.15-1) - identity=73.9; qcov=0.914; evalue=7.77e-177; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF07993 (NAD_binding_4); PF08338 (DUF1731)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783149.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057783149.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057783149.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783149.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11716732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr8:11716912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:11717289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B30,C28,C64,C66
`Chr8:11717637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11718803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B53,B71,C8,D8
`Chr8:11719517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:11719868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B30,C28,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783149.1

348 aa

174

348

Epimerase

NAD_binding_4

3Beta_HSD

DUF1731

PF01370 Epimerase 50-266 aa PF07993 NAD_binding_4 51-82 aa PF01073 3Beta_HSD 51-147 aa PF08338 DUF1731 300-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783149.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	50	266	1e-22	81.4	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057783149.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	51	82	3.7e-05	23.7	Male sterility protein
`XP_057783149.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	51	147	8e-06	25.8	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057783149.1`	Pfam	`PF08338`	DUF1731	Family	300	346	1.4e-17	63.9	Domain of unknown function (DUF1731)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927166.1
GATATGGCGTGGCTCTACATGATACACATTTTGTTTGCTCAACCAAGGAGCAATGGACCCCTTTCACTCAAACAATACCACCACCACACCATACTTTCACATTCATCCTCTCAATTTCTTATGAAAAATGGAACTCTGTGGAGCCACTTCAATTTCTTGGGCGAATTCCATAACTCCTCATCACTTTCCACAAACACTCTCAGTTTGGAAGCTTCGGCAAACAAGAGTTTTCTCTGTAACTAGCAGCAATGACAAGGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001004
ATGGAACTCTGTGGAGCCACTTCAATTTCTTGGGCGAATTCCATAACTCCTCATCACTTTCCACAAACACTCTCAGTTTGGAAGCTTCGGCAAACAAGAGTTTTCTCTGTAACTAGCAGCAATGACAAGGCAGATGAGATGATCGTTTCAGTAACTGGAGCCACTGGGTTCATAGGTAAAAGATTGGTGCAGAGATTGCTTGCAGATGATCATCGTGTGCGGGTCTTGACACGATCTAGGTCAAAAGCCCTGTCAATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783149.1
MELCGATSISWANSITPHHFPQTLSVWKLRQTRVFSVTSSNDKADEMIVSVTGATGFIGKRLVQRLLADDHRVRVLTRSRSKALSIFPARDYPGIKIAEEPEWRNCIQGSTAVVNLAGLPISTRWSPEIKKEIKESRIKVTSKVVDFINSTQDDLRPKVLVSATAVGYYGTSETRVFDEESPSGNDYLAEVCREWEATALRVNKDVRLARIRIGVVLGKEGGALAKMIPLFMMFAGGPLGSGKQWFSWIHVDDLVSLIYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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