当前解析结果
SmilChr08G001471| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001471 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001471 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001471 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 11861996 - 11862617 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001020 |
|---|---|
| GeneID | 131001020 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001020 |
| 原始查询 | LOC131001020 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001020 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057783168.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057783168.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783168.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783168.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783168.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:11862129 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 103 | A1,A10,A11,A15,A16,A19,A2,A20,A23,B1,B101,B102,B104,B109,B11,B110,B112,B119,B120,B121,B123,B128,B129,B131,B133,B134,B136,B137,B16,B17,B2,B20,B24,B26,B3,B35,B36,B37,B41,B43,B44,B5,B50,B56,B58,B59,B6,B62,B65,B66,B76,B77,B79,B80,B81,B83,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B96,B99,C11,C14,C20,C22,C27,C32,C34,C36,C40,C43,C44,C45,C46,C48,C50,C53,C54,C56,C57,C60,C61,C64,C66,C67,C68,C72,C74,C75,C79,C8,C80,C81,C82,C87,D2,D4,D7 |
Chr8:11862191 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr8:11862558 |
C |
CGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 27 | A1,A21,A8,B124,B128,B14,B17,B18,B27,B28,B34,B46,B57,B78,C16,C19,C29,C32,C42,C50,C52,C61,C68,C74,C75,C8,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。