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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001485`

染色体: Chr08 坐标: 11960698-11963284 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001485`
名称	SmilChr08G001485
描述	eukaryotic translation initiation factor 4B3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11960698 - 11963284 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001034`
GeneID	`131001034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001034`
原始查询	`LOC131001034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 4B3-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 4B3-like
Arabidopsis	`AT4G38710` (AT4G38710) glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830027] identity=45.8; qcov=1.13; evalue=2.92e-64; confidence=high
Rice	`Os02g0439700` - identity=36.3; qcov=1.17; evalue=7.63e-43; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF06273 (eIF-4B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783188.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057783188.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057783188.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783188.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057783188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11960931`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B85
`Chr8:11960931`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B85
`Chr8:11961090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B108,B53,B71,D8
`Chr8:11961228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C82
`Chr8:11961231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B43,D11
`Chr8:11961251`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr8:11961251`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr8:11961282`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A1,A14,A19,A2,B10,B117,B120,B121,B126,B127,B136,B137,B18,B29,B3,B43,B56,B60,B81,B84,B86,B90,B96,C11,C12,C20,C33,C35,C46,C47,C52,C73,C75,C84,D10,D11,D2
`Chr8:11961311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C82
`Chr8:11961315`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B100,B115,B17,B23,B49,B63,B75,B80,B84,B96,C67
`Chr8:11961332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B11,B130,B39
`Chr8:11961349`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A2,A22,B101,B133,B37,B55,C16,C69,C77,C82,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783188.1

385 aa

192

385

eIF-4B

PF06273 eIF-4B 7-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783188.1`	Pfam	`PF06273`	eIF-4B	Family	7	320	3.2e-46	159.1	Plant specific eukaryotic initiation factor 4B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927205.1
GTGGTGACAATATGAGGAAAATTTCATGAAAATTGGTAAATGCAATCGCAACCGTAGACGAAGCATGAAATTCGTGGCGTTAGATCATATTCTGAGAGAAGGAAGAGATGCGTTTTTGGCTTTTAAGAAACGCAGGATCTTCAGGAAACCTACCCTTACACGCACTATTGCACCTTCAAAAACGCAAACTGCAATAGCTTTTCTTGTACATAGACAAGAATGGCGGCAACGGTGAGCCCGTGGGGAAAGCCTGGCGCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001034
ATGGCGGCAACGGTGAGCCCGTGGGGAAAGCCTGGCGCGTGGGCATTGGATGCCGAAGAGAACGAGTCCGAGCTTCTCCAGCAGACCAAGGAAGACTGTTCTGCGCCTCTCGGCGGAGAAACGCCTGATTTTCCATCACTCTCCTCCGCCGCCTCCTCCAAGACTAAGAAGAAGAAGCCGCAGGCGCTATCACTTCAGGAATTCTCGGCCTACAGCTCGCCCAAGCCCAAGGGATTGACTCACGATGAGCTATCAGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783188.1
MAATVSPWGKPGAWALDAEENESELLQQTKEDCSAPLGGETPDFPSLSSAASSKTKKKKPQALSLQEFSAYSSPKPKGLTHDELSALPTGPRERSAEELDRNKLGGGFRSYGGGSRDEQPRHQGSFNRESGRELGPSRADETDDWGANKKTSGSTGFERRERGERGGFFGDTQSRADEVDNWASNKNFAPSEPRRYEKRGGFGLESADGGSDSSNWGKRKEEEGRRSGGAFDSLRERRGGMEADSESWGRKREESSGGNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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