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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001487`

染色体: Chr08 坐标: 11978428-11982248 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001487`
名称	SmilChr08G001487
描述	auxin transporter-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11978428 - 11982248 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001036`
GeneID	`131001036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001036`
原始查询	`LOC131001036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin transporter-like protein 5
产物	auxin transporter-like protein 5
Arabidopsis	`AT2G21050` (LAX2) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816640] identity=84.6; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0244600` (OsLAX2) - identity=83.5; qcov=0.935; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783191.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783191.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783191.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783191.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11978685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B61
`Chr8:11978803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B2,B52,B99,C87
`Chr8:11978812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C34,D8
`Chr8:11979083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B2,B52,B99,C87
`Chr8:11979107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:11979152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:11979173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B108,B35,C34,D8
`Chr8:11979402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B71
`Chr8:11979545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C36,C38,C55
`Chr8:11980867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C85
`Chr8:11981281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B22,C82
`Chr8:11981478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783191.1

494 aa

247

494

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 38-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783191.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	38	431	4.1e-79	266.9	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927208.1
CGTCTAACAAAAAAAGACAAAACAAGGTTTAAGCAATCAAGAAATCGCGTCTTCTCTCATCCTCCAAAAAGCGTGTCCACTCCTCTTCCCTAAAATCCACTCTCTTTCTTCACTTGGCCACCACCACCGCGCTTTCTATATATACACACCCCGGTTGTATGTATTTTCGCACAAATTGAGTAGTTAATTAAGCAAACATGGCGGCGTCCGACAAGGTGGTGGAGAGCGTCATCGCCGGAAACTACGAAGAAATGGAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001036
ATGGCGGCGTCCGACAAGGTGGTGGAGAGCGTCATCGCCGGAAACTACGAAGAAATGGAGAGCGACGGGAAGCCCCGAGGCATTAGGTCCACCATTTCCAACTTCTTCTGGCACGGCGGCTCCGTCTACGACGCTTGGTTCAGCTGCGCTTCTAACCAGGTGGCGCAGGTGCTGCTGACGTTGCCATACTCGTTTTCTCAACTAGGGATGACGTCAGGGATTCTGTTCCAGCTGTTCTACGGCCTCATGGGGAGTTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783191.1
MAASDKVVESVIAGNYEEMESDGKPRGIRSTISNFFWHGGSVYDAWFSCASNQVAQVLLTLPYSFSQLGMTSGILFQLFYGLMGSWTAYLISILYVEYRTRKEREKVDFRNHVIQWFEVLDGLLGKHWRNVGLAFNCTFLLFGSVIQLIACASNIYYINDNLDKRTWTYIFGACCATTVFIPSFHNYRIWSFLGLIMTTYTAWYLTIASLLHGQVEGVKHSGPTKLVLYFTGATNILYTFGGHAVTVEIMHAMWKPQKFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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