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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001491`

染色体: Chr08 坐标: 12025150-12028285 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001491`
名称	SmilChr08G001491
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12025150 - 12028285 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001040`
GeneID	`131001040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001040`
原始查询	`LOC131001040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
Arabidopsis	`AT4G34950` (AT4G34950) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829647] identity=69; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0536700` (OsMFS5) - identity=67.7; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057783195.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057783195.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057783195.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783195.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783195.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12025613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B22,C82
`Chr8:12025730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:12025739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B1,B27,B72
`Chr8:12025840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:12027126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,D10,D11
`Chr8:12027192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:12027259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B121,B21,B79,C54
`Chr8:12027334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:12027507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783195.1

540 aa

270

540

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 13-259 aa PF23262 NFD4_C 310-521 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783195.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	13	259	1.9e-96	323.1	Nodulin-like
`XP_057783195.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	310	521	6.8e-29	101.9	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927212.1
TATATTTATATAAAAGGAAAAAGTGGAAACTGAAAAGTATCCCTTTAAATAAAGGTTCCCCAACACGGCATATCTCACACCAACTTCCAAATTCCACCTCTCGTCTCTCCACATTCGAAATATTTCTCAAAATATATTTCGCCATGGGTGTAAAACTCTCACCGGCCTCCCCCGCCGGCAAATGGCTCGGCCTTGTCACCGCCGTCTGGGTGCAAGCGATTTCCGGCAACAATTACACCTTCTCTAATTACTCCGACGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001040
ATGGGTGTAAAACTCTCACCGGCCTCCCCCGCCGGCAAATGGCTCGGCCTTGTCACCGCCGTCTGGGTGCAAGCGATTTCCGGCAACAATTACACCTTCTCTAATTACTCCGACGCCCTCAAAACACTGATGGGCCTCACTCAACTCGAGCTCAACAGCCTCTCCGTCGCCAAAGACGTCGGCAAAGCATTCGGTATCTTCGCCGGACTCGCCTCCGACCGCCTTCCTACCCCCGTCATCCTCCTCATTGGCTCCGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783195.1
MGVKLSPASPAGKWLGLVTAVWVQAISGNNYTFSNYSDALKTLMGLTQLELNSLSVAKDVGKAFGIFAGLASDRLPTPVILLIGSVEGFVGYGVQWLVVSGRIQPLPYWAMCIFLCMGGNSTTWMNTAILVTCIRNFRKNRGPVSGILKGYVGLSTAIFTDVCSALFGDDPAKFLMMLTVVPFIVCLASMFFLREIPPSQTAGEEREETKFFGIINVIAVIIALYLLAFDVTGTHGRLFSQFFAAILLVLLASPLLIPIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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