当前解析结果
SmilChr08G001501| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001501 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001501 |
| 描述 | proteasome subunit alpha type-7 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 12157400 - 12160535 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001049 |
|---|---|
| GeneID | 131001049 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001049 |
| 原始查询 | LOC131001049 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | proteasome subunit alpha type-7 |
| 产物 | proteasome subunit alpha type-7 |
| Arabidopsis | AT5G66140 (PAD2)proteasome alpha subunit D2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836746] identity=91.7; qcov=0.912; evalue=5.27e-158; confidence=high |
| Rice | Os09g0538200 (OsPAD1)- identity=89.91; qcov=0.912; evalue=7.3e-156; confidence=high |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0019773 (proteasome core complex, alpha-subunit complex) |
| KEGG | smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00227 (Proteasome); PF10584 (Proteasome_A_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001049 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783202.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057783202.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057783202.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783202.1PF10584
Proteasome_A_N 4-26 aa
PF00227
Proteasome 27-210 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783202.1 |
Pfam | PF10584 |
Proteasome_A_N | Family | 4 | 26 | 3.3e-14 | 52.9 | Proteasome subunit A N-terminal signature |
XP_057783202.1 |
Pfam | PF00227 |
Proteasome | Domain | 27 | 210 | 1.6e-57 | 194.9 | Proteasome subunit |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。