当前解析结果
SmilChr08G001504| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001504 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001504 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001504 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 12190031 - 12192103 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001052 |
|---|---|
| GeneID | 131001052 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001052 |
| 原始查询 | LOC131001052 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0482100; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os08g0482100; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G11560 (AT3G11560)LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820329] identity=25; qcov=1; evalue=1.8e-07; confidence=low |
| Rice | Os08g0482100- identity=36.7; qcov=1; evalue=5.86e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001052 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057783207.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057783209.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057783209.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057783207.1 |
| 5 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057783210.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:12190773 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B65,C58,C76 |
Chr8:12190883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr8:12191307 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA6 records
下载 CDS FASTA6 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。