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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001510`

染色体: Chr08 坐标: 12246967-12249263 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001510`
名称	SmilChr08G001510
描述	squalene epoxidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12246967 - 12249263 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001055`
GeneID	`131001055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001055`
原始查询	`LOC131001055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squalene epoxidase 3-like
产物	squalene epoxidase 3-like
Arabidopsis	`AT1G58440` (XF1) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842213] identity=70.6; qcov=0.877; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0231800` - identity=70.3; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004506 (squalene monooxygenase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016020 (membrane); GO:0016126 (sterol biosynthetic process); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01494 (FAD_binding_3); PF08491 (SE); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057783216.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057783216.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057783216.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057783216.1`
5	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057783216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12247876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:12248127`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B29,B45,B77
`Chr8:12248127`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B29,B45,B77
`Chr8:12248418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:12248428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:12248757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783216.1

536 aa

268

536

FAD_binding_2

DAO

FAD_binding_3

NAD_binding_8

PF00890 FAD_binding_2 61-90 aa PF01266 DAO 61-91 aa PF01494 FAD_binding_3 61-404 aa PF13450 NAD_binding_8 64-91 aa PF08491 SE 210-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783216.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	61	90	4.3e-05	23.6	FAD binding domain
`XP_057783216.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	61	91	9.4e-12	45.8	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057783216.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	61	404	2.2e-15	57.5	FAD binding domain
`XP_057783216.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	64	91	6.8e-06	27.0	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057783216.1`	Pfam	`PF08491`	SE	Family	210	479	2e-116	388.6	Squalene epoxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927233.1
GACGTGTAGCAGAATTTCGTGTCACCCCCTGTTCAATCAAAATTCCTTGTTTAATCTAAAAACATGTGATTTATTGTAATAATCTAACAATATTGACTCTTGACTCATTTTCTTGATTTCTAACAGCGTGTTTTTCCACAACCACCACCCTTCTAGTCCAACTTGGAGAGCTCACTTATTCTACTGCACTTAATTAATTTTGTCTTTGTTTGAGGAATGGGCTGTCTATATATATAGATTGCAAGAAAGAAACTGATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001055
ATGGAGTTGGATATGATGGAACAATATGTGGTAGGTGGTTTCATTGCTTTGGTTCTTGGTTTGATGTTATTACAAAGGTTGAGAAGAGGTGGAGACAAAAACATAAAAAAGGCTGCGGTTAGAGATGCGGGAGTTGAGGCTTGTTCAGACAAGGTTGTGCGTGGAGCTGATGGGCCACCGGATGTTGTGATTGTTGGTGCCGGTGTAGCTGGTTCAGCACTGGCTTACACTTTGGCAAAGGATGGGCGCGTGGTGCTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783216.1
MELDMMEQYVVGGFIALVLGLMLLQRLRRGGDKNIKKAAVRDAGVEACSDKVVRGADGPPDVVIVGAGVAGSALAYTLAKDGRVVLVIERDLRQPDRIVGELLQPGGYLKLVELGMEECVSGIDSQQVYGYALYKEGKYAKLTYPLQEYSSDVSGRSFHHGRFIQSLRRKAASLPNVRMEQGTVSSLIEAKGSVKGVKYKNKDGEDVKAFAPLTIVCDGCFSNLRKNLCIPQVNIMSHFVGMVLNLENGKLPQPNHGHVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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