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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001516`

染色体: Chr08 坐标: 12302852-12305169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001516`
名称	SmilChr08G001516
描述	chloroplast protein FOR GROWTH AND FERTILITY 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12302852 - 12305169 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001060`
GeneID	`131001060`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001060`
原始查询	`LOC131001060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplast protein FOR GROWTH AND FERTILITY 2-like
产物	chloroplast protein FOR GROWTH AND FERTILITY 2-like
Arabidopsis	`AT2G16800` (AT2G16800) high-affinity nickel-transport family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816181] identity=66.9; qcov=0.945; evalue=3.38e-153; confidence=high
Rice	`Os06g0116400` (ZN) - identity=73.8; qcov=0.734; evalue=1.83e-136; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13386 (DsbD_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001060

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783221.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057783221.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783221.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783221.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12303533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B61
`Chr8:12303534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B25,C82
`Chr8:12303624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:12304734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14
`Chr8:12304737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B35,B46,B76,C14
`Chr8:12304755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:12304756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B64,C10,C31,C38
`Chr8:12304919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C45,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783221.1

384 aa

192

384

DsbD_2

PF13386 DsbD_2 211-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783221.1`	Pfam	`PF13386`	DsbD_2	Family	211	356	4.8e-06	27.3	Cytochrome C biogenesis protein transmembrane region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927238.1
TAAGAATTGGAGTGAGAAAGGAAAGATTTGTGAGAATTTAGAAAGGAAAGATACGGTTAAACTGCCAACCAGGAGAGTCGGTACACAAATCCTACAGTCTCTGCTCTATCTTCTTTAACTCATCTTTCAACCCTAAAATCTCTGATTTCCAGTTCCACTTCTTTTCAAATAAAAGGGGGGAAATTTCCTCGAGCAGTTTGTGGGTAGAATTAGCAACATCATGGAGAGGTTGATCTACTCCAATACCATTCCTCTCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001060
ATGGAGAGGTTGATCTACTCCAATACCATTCCTCTCAAACGCCGCTTCAATTCGCCGCTTATTCCACAACTCGCTCAAGCGGACTCGCCCCAGAGACTCCGACCGTCTTCATTGTTTCCTTCGTCTTCGTTTCCGCGCCGATTCAACCCGGTTTCTTGCATTTTCAGTGTGAGCAACTCAGGTTTTCTTTTCCGCAAAGGTGTGGATGATTCGCCGGAGATTAATTTGGAGTCTTCCGTGGATTCGGGCAATGGGTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783221.1
MERLIYSNTIPLKRRFNSPLIPQLAQADSPQRLRPSSLFPSSSFPRRFNPVSCIFSVSNSGFLFRKGVDDSPEINLESSVDSGNGSAPEPSFLKWVSQKLSRQQKVVNAGKVILLSAFILTFLHPATVSPAFASIQTAANSGGPAAVAVGNTLIRSELLSSAWTGFFAGCLHTLSGPDHLAALAPLSIGRSKMESAAVGALWGCGHDAGQVLFGLLFLLLKDRLHIEVIRTWGTRVVGLTLLVIGAMGIREASEVPVPCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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