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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001519`

染色体: Chr08 坐标: 12345293-12348557 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001519`
名称	SmilChr08G001519
描述	uncharacterized SmilChr08G001519
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12345293 - 12348557 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001062`
GeneID	`131001062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001062`
原始查询	`LOC131001062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837038]; symbol=AT1G05370; hit=AT1G05370; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837038]; symbol=AT1G05370; hit=AT1G05370; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G05370` (AT1G05370) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837038] identity=55.5; qcov=1.15; evalue=3.69e-152; confidence=high
Rice	`Os03g0219100` - identity=52.5; qcov=1.13; evalue=3.83e-136; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057783224.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057783224.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057783224.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783224.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12345470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:12345598`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A23,B12,B43,C2,C34,C48
`Chr8:12345601`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A23,B12,B43,C2,C34,C48
`Chr8:12345780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B19,B30,C64,C66
`Chr8:12345792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B123,B34
`Chr8:12345813`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C55
`Chr8:12345813`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C55
`Chr8:12345838`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A23,B1,B12,B43,C2,C34,C48
`Chr8:12345857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:12345867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D6
`Chr8:12345915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B64,C41
`Chr8:12346064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C34,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783224.1

350 aa

175

350

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 80-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783224.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	80	193	4.4e-20	72.8	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927241.1
CCCAATCACGCCTCTCTTTATCTCTCTCTCACTTTACTATAGGTGGCAAGAGAAACATTTTTGAAAAACAAAATTGGTTGAAGAAGTTTGGTGTGGTTTGTTTGAGTTATTCATTTCACACACACAAAACAGAGTGAGCATCTTTCTTGTATTCTCTTTCAAGAAAAATGGGATTTGGAGACGATAATCACAGAGTTCAATCCGTTGTTGAACTGCTCAAGAAACAATCTCCACTTTCTCCCAAACAGGAGAGATTCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001062
ATGGGATTTGGAGACGATAATCACAGAGTTCAATCCGTTGTTGAACTGCTCAAGAAACAATCTCCACTTTCTCCCAAACAGGAGAGATTCTGCAACAATGCATGCGTGGAGAGGTTTCTTAAAGCCAAAGGCGATAGTGTGAAGAAAGCAGCTAAACATCTCAGAAATTGCCTTTCTTGGAGAGATTCCTTTGCCGTTGATCATTTGATGGCTGATGAATTCTCTCCTGAGCTTGCTGAAGGAATGGCGTATGTTGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783224.1
MGFGDDNHRVQSVVELLKKQSPLSPKQERFCNNACVERFLKAKGDSVKKAAKHLRNCLSWRDSFAVDHLMADEFSPELAEGMAYVAGHDDELRPVMIFRIRQDYQKFHSQKLFIRLLVFTLEVAVQTMGKNVEQFVLLFDASLFKSAAAFTNMLVASLKIIADNYPRRLHKAFVIDPPSLFSYLWKGVRSFVEVSSVTMTISSVELEESFRLDDLKAYPKMGSCSSSRFSFTVSHHLDSVKPWYLSLKDASGGPRMNGRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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