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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004295`

染色体: Chr01 坐标: 61142915-61146589 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004295`
名称	SmilChr01G004295
描述	CDK5RAP3-like protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61142915 - 61146589 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001072`
GeneID	`131001072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001072`
原始查询	`LOC131001072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CDK5RAP3-like protein
产物	CDK5RAP3-like protein
Arabidopsis	`AT5G06830` (AT5G06830) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830574] identity=62.7; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0320100` - identity=58.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0007346 (regulation of mitotic cell cycle); GO:0012505 (endomembrane system)
KEGG	-
Pfam	PF05600 (CDK5RAP3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057783246.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783246.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057783246.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057783246.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057783246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61143175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:61143782`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C10
`Chr1:61143782`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C10
`Chr1:61143850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:61144206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C1,C82,D11
`Chr1:61144690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:61144843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:61145527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B46,B68,B84
`Chr1:61146062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783246.1

570 aa

285

570

CDK5RAP3

PF05600 CDK5RAP3 8-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783246.1`	Pfam	`PF05600`	CDK5RAP3	Family	8	558	2.1e-164	548.8	CDK5 regulatory subunit-associated protein 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927263.1
AGAACGATGAATGAAAGTACCCAAGTTTGATTGATTTTGGGCTTTGAGCCCAATTTGAACCGAGTACAAGCCCCACGTATTACGCCTTTGCTACATACAGACGAAGGAAATGACAGCCTGAAACGCAACTGTGAAACTTCAGAGCTGAATAAATTCCAAAATCACGAACGATTTGTAGCAGATTTATGCTTCGCCTAAATCCAAAATCATCAGCTCGACGAAATGCAGAATGAAGAGGAAATTCGGAAACTCCCGATCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001072
ATGCAGAATGAAGAGGAAATTCGGAAACTCCCGATCGACATCGCGTTTGCTCGTCTCGGAGAATGGCTGGTGGATCGGAAGAGGATTCCGGCGGATTGGAGGAAGCGAATGACGGCTGTGAGGGCGAAGATTACGACGTCGTTTGCTGCACTTCCCAAAGACATTGATCTTTTTTTCCAAACCCTCGACCTCGAAGGAATTGGCTACTTGGAAGCAAAGAAAATATATGAAATCCTTTTAAAGTCAACTCCAGAAAGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783246.1
MQNEEEIRKLPIDIAFARLGEWLVDRKRIPADWRKRMTAVRAKITTSFAALPKDIDLFFQTLDLEGIGYLEAKKIYEILLKSTPESRNIFGRRSGAAGDWETIVLAYEKDHIFLGEAAQIMVQNVNYEIPYQKKQVQKSQQQLVELERKEADIKRNAALSAAKYSEACQELGLQGVNVRSELFETAVTSLPSTFSQMLEVLNSDSVTTAIEFYSTFVKDAHTEKDKTPSPVLPNLIDIRLNPPSLNVFVSPEVFGVVTTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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