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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001531`

染色体: Chr08 坐标: 12455996-12459374 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001531`
名称	SmilChr08G001531
描述	uncharacterized SmilChr08G001531
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12455996 - 12459374 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001076`
GeneID	`131001076`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001076`
原始查询	`LOC131001076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ER-based factor for assembly of V-ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835377]; symbol=AT5G52980; hit=AT5G52980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ER-based factor for assembly of V-ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835377]; symbol=AT5G52980; hit=AT5G52980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G52980` (AT5G52980) ER-based factor for assembly of V-ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835377] identity=62.3; qcov=0.861; evalue=3.97e-80; confidence=high
Rice	`Os02g0225300` - identity=39.2; qcov=0.221; evalue=3.8e-07; confidence=weak
GO	GO:0012505 (endomembrane system); GO:0070072 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF11712 (Vma12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001076

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057783248.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057783248.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057783248.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783248.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12456736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:12456930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B64,C10
`Chr8:12456984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783248.1

231 aa

116

231

Vma12

PF11712 Vma12 91-198 aa

XP_057783249.1

231 aa

116

231

Vma12

PF11712 Vma12 91-198 aa

XP_057783250.1

231 aa

116

231

Vma12

PF11712 Vma12 91-198 aa

XP_057783251.1

231 aa

116

231

Vma12

PF11712 Vma12 91-198 aa

XP_057783252.1

231 aa

116

231

Vma12

PF11712 Vma12 91-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783248.1`	Pfam	`PF11712`	Vma12	Family	91	198	7.5e-07	29.9	Endoplasmic reticulum-based factor for assembly of V-ATPase
`XP_057783249.1`	Pfam	`PF11712`	Vma12	Family	91	198	7.5e-07	29.9	Endoplasmic reticulum-based factor for assembly of V-ATPase
`XP_057783250.1`	Pfam	`PF11712`	Vma12	Family	91	198	7.5e-07	29.9	Endoplasmic reticulum-based factor for assembly of V-ATPase
`XP_057783251.1`	Pfam	`PF11712`	Vma12	Family	91	198	7.5e-07	29.9	Endoplasmic reticulum-based factor for assembly of V-ATPase
`XP_057783252.1`	Pfam	`PF11712`	Vma12	Family	91	198	7.5e-07	29.9	Endoplasmic reticulum-based factor for assembly of V-ATPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927267.1
CACGTTTTACGATCGTCTACAACAAATTGAAAGATTGTGCTACAGCACACAATCAGAAAACATAAAAATGTCAAAATCCACCTAATCTGCAAATAGCCACATAAAGCGCAGGCTCTCAATCTGGCTAACAATTTGCATAACAGATCATAGATAGATGGCATTTAAATTTGGAAATTCTTGTAGCAGCAAAAACAAAAATAGATGCAAAGGTAATTTTGTCATCTTACAGCAAAAACACAAAAGCCTTTAAATTGGTAGTG...

XM_057927269.1
TTACGATCGTCTACAACAAATTGAAAGATTGTGCTACAGCACACAATCAGAAAACATAAAAATGTCAAAATCCACCTAATCTGCAAATAGCCACATAAAGCGCAGGCTCTCAATCTGGCTAACAATTTGCATAACAGATCATAGATAGATGGCATTTAAATTTGGAAATTCTTGTAGCAGCAAAAACAAAAATAGATGCAAAGGTAATTTTGTCATCTTACAGCAAAAACACAAAAGCCTTTAAATTGGTAGTGTATAAC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131001076
ATGGTCACAGAAGCCAACGACGCCGTTTCCTCCAAACTGTCAACCACCGCTGTACTGTCACCGACCACCTCCTCCTCCAGCGGCGGCGCCCTTATCATATCAATTACAGGTGCGATGCGTTCCTTCCTCACCGCATCTTCCACTGATTTACATCTATCGGAGGATCTCAGACACCTTTCTTCTTCGCTTATCCTCCAGTCGACCGCACCCTACCAATCCCTAAAAACGATCTGGTTCGGATCCGAATTCGGTTCCAGACC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057783248.1
MVTEANDAVSSKLSTTAVLSPTTSSSSGGALIISITGAMRSFLTASSTDLHLSEDLRHLSSSLILQSTAPYQSLKTIWFGSEFGSRPDLSSLLAGSNFIFASPTPRQKSEELKARLRQLEEAAERKAYDELVKDITPRKPVNEPFSSYKDQLGFGLHVVVTMFTGYLVGYAAFRALFGQSPPMSAAGGILGLVGAMLVETLLFILRSSDLGGESSSSSTSRPSNLKIKKNQ

XP_057783249.1
MVTEANDAVSSKLSTTAVLSPTTSSSSGGALIISITGAMRSFLTASSTDLHLSEDLRHLSSSLILQSTAPYQSLKTIWFGSEFGSRPDLSSLLAGSNFIFASPTPRQKSEELKARLRQLEEAAERKAYDELVKDITPRKPVNEPFSSYKDQLGFGLHVVVTMFTGYLVGYAAFRALFGQSPPMSAAGGILGLVGAMLVETLLFILRSSDLGGESSSSSTSRPSNLKIKKNQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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