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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001566`

染色体: Chr08 坐标: 12870431-12873542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001566`
名称	SmilChr08G001566
描述	armadillo repeat-containing protein LFR
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12870431 - 12873542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001109`
GeneID	`131001109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001109`
原始查询	`LOC131001109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	armadillo repeat-containing protein LFR
产物	armadillo repeat-containing protein LFR
Arabidopsis	`AT3G22990` (LFR) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821873] identity=67.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0609766` (LFR) - identity=66.9; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005654 (nucleoplasm); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016514 (SWI/SNF complex); GO:0031491 (nucleosome binding); GO:0035060 (brahma complex); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783320.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783320.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057783320.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783320.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783320.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12870744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr8:12870761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B19,B30,C64,C66
`Chr8:12870982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B134,D3
`Chr8:12871010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:12871396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73
`Chr8:12871404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:12871452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:12871617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B97,C14
`Chr8:12871740`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A1,A25,B102,B107,B15,B21,B22,B4,B41,B53,B72,B79,B94,B99,C31,C39,C44,C47,C86
`Chr8:12871808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C30,C46
`Chr8:12871817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:12871999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927337.1
ATCGAACCAGTAGCTAGTTTGGAGTGACCTAGTTTGTATAAAAGAAATAAAAGAAAAAAAAATCGTTTGGTACCAATAAACCAGTAGCTATATTAGAATGATTATTTTTTACTCGTCTGTGTGCGATTTTTTACATTTAGTTTTATAAACATATGTGTTTATTACTTACTTTATCTTTTTTTTTTTCAATTAAAAATATAATCTTGACAGAGTGCATGCAAATTCAAGTTTTATTCAAGCATAACCCGAAATACATTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001109
ATGCAAAAGAGAGAGCAAAACAAGCTGGGCGGAGCTGCGGGCGGCTCCGCCCCTCCCGCCGCCAAGAGAGGCCGTCCTATAGGCAGTGGAAGCAACAGCGCCGCTTTATCTGCCGCAGCCACAGCTGCGGCTGCGGCTTCCGGTGATACTATCGCACCCTCCACCCTCCTCGGCCCCTCGCTCCAGGTCCACTCCGCCTTCGCCGAGCAGAATAACAAAAGGATAGTTATGGCTCTTCAAAGTGGATTGAAGAGTGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783320.1
MQKREQNKLGGAAGGSAPPAAKRGRPIGSGSNSAALSAAATAAAAASGDTIAPSTLLGPSLQVHSAFAEQNNKRIVMALQSGLKSELTWALNALTLLSFKEKDEVRKDATPLARIPGLLDALLQVIDDWRDIALPRVLAKTPRARLLGANSAVTGFGSEYETVNTGDSVPHPTAGSGSSNKDLSAQKSSSKSRPSGWWFEEDGLFNLDDEGRAEKQQCAVAASNIIRNFSFMAENELAMGQNRHCLETMFQCLEDYVTED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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