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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004292`

染色体: Chr01 坐标: 61132968-61135174 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004292`
名称	SmilChr01G004292
描述	uncharacterized SmilChr01G004292
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61132968 - 61135174 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001115`
GeneID	`131001115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001115`
原始查询	`LOC131001115`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824960]; symbol=AT3G57910; hit=AT3G57910; species=arabidopsis; confidence=high
产物	D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824960]; symbol=AT3G57910; hit=AT3G57910; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G57910` (AT3G57910) D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824960] identity=57.9; qcov=1; evalue=1.13e-82; confidence=high
Rice	`Os08g0509500` - identity=46.2; qcov=0.992; evalue=4.04e-45; confidence=medium
GO	GO:0000776 (kinetochore); GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF01585 (G-patch); PF12656 (G-patch_2); PF13821 (DUF4187)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783344.1`
2	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057783344.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783344.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783344.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783344.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61133903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:61134030`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B89
`Chr1:61134030`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B89
`Chr1:61134756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783344.1

251 aa

126

251

G-patch_2

G-patch

DUF4187

PF12656 G-patch_2 67-125 aa PF01585 G-patch 81-124 aa PF13821 DUF4187 199-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783344.1`	Pfam	`PF12656`	G-patch_2	Domain	67	125	1.4e-07	32.2	G-patch domain
`XP_057783344.1`	Pfam	`PF01585`	G-patch	Family	81	124	1.5e-15	57.6	G-patch domain
`XP_057783344.1`	Pfam	`PF13821`	DUF4187	Domain	199	251	1.4e-17	63.9	Domain of unknown function (DUF4187)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927361.1
AGATTATGAAGATCTTACTGCATTGGATCAAAATCATTTCAACTCGACGTTGTGTTATCGCAGACGAGATCTTCTATTTTTAAAAAATGGAGGCTTGTTTCTTGAGATACAATTGGAGCAGTGCAAATATGAACCTAAGATGTTAATTTGAATTTTTTAAAACTAACAATTACTTGAAAACTAGTTTAGCTCTATTAATTGATTATATAATCAACACACAAAATTATAATTCCAAATATAAACAAGGGCATATCATATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001115
ATGGCTGGAGGCGACGAAGATGATGATTACATGGGAGACCTCTCCCGGTTTGTACCAACGGCGGTTCCTCAATCTTCCTCCAAAAAGGAGCCTAGTAGTAATCTTGTAGTGTCGAAATCTTCGTCGAGCAAGAAATCGAAATTCCAAAACTGGCAGGAGCAGAGGAAGCTCGACCGAAAAAGGAAGCAAAGCGAAGAGGATAAACAAACATTAGAAAATGCAGGTTCTGCAATACCACAGTCTAATATTGGTTTCAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783344.1
MAGGDEDDDYMGDLSRFVPTAVPQSSSKKEPSSNLVVSKSSSSKKSKFQNWQEQRKLDRKRKQSEEDKQTLENAGSAIPQSNIGFKLLKQMGYTPGSALGKEGSGRAEPVSLEIRRGRAGIGTEDPEVAKMRRERAKYEMNKRKESELMEIFGSHQKERWKGRRVIVNFRKADATLAQLENREVVVEKKEENDEEKEGEEEEEEEEITEEDLLNILLKLRNEFKYCLFCGCQYDTMEALESECPGINEDDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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