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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001575`

染色体: Chr08 坐标: 12972808-12975670 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001575`
名称	SmilChr08G001575
描述	stem-specific protein TSJT1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12972808 - 12975670 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001118`
GeneID	`131001118`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001118`
原始查询	`LOC131001118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stem-specific protein TSJT1-like
产物	stem-specific protein TSJT1-like
Arabidopsis	`AT3G22850` (AT3G22850) aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821857] identity=70; qcov=0.996; evalue=1.35e-131; confidence=high
Rice	`Os03g0744600` - identity=57.9; qcov=1; evalue=2.05e-109; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12481 (DUF3700); PF13522 (GATase_6); PF13537 (GATase_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001118

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783348.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783348.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783348.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783348.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12974128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B140,B41,B99,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783348.1

251 aa

126

251

DUF3700

GATase_7

GATase_6

PF12481 DUF3700 2-227 aa PF13537 GATase_7 75-170 aa PF13522 GATase_6 77-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783348.1`	Pfam	`PF12481`	DUF3700	Domain	2	227	1.1e-108	362.7	Aluminium induced protein
`XP_057783348.1`	Pfam	`PF13537`	GATase_7	Domain	75	170	1.8e-08	35.2	Glutamine amidotransferase domain
`XP_057783348.1`	Pfam	`PF13522`	GATase_6	Domain	77	177	1.1e-07	32.1	Glutamine amidotransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927365.1
GAGGGAGGGCATTTCCGTCCAAACACACACCTACACAATTCTCCCCTTTTGTTATTTAAACAGAAAACTGTTGGGATCAAATTCTTTGATTTTGGCTTTCAACAACTTCTTCATCCCACATCATCAACTGAAATCAAGACATCGATCTCTCTCCGCTTCGGTCGCGTAAAGAAATGTTGGCTGTTTTCGACAAATCGGTGGCGAAAAGCCCAGATGCACTGGCGCAGAATCCACAAAATGAATCGCTTCCCGCACTCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001118
ATGTTGGCTGTTTTCGACAAATCGGTGGCGAAAAGCCCAGATGCACTGGCGCAGAATCCACAAAATGAATCGCTTCCCGCACTCGAAGACAAATTCTTGGCCACCTATTTCTCGTCCGTACACCCGGGCTCCGTCGTCATTAACCTCGCCTCTTCCGGTTTCATGGCCTACTCTTCTGACAGACAAAACCCTATTCTCCCCAGACTGTTTGGAGTTGTGGATGACATATTCTGCTTATTCGAAGGCCACATCCAGAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783348.1
MLAVFDKSVAKSPDALAQNPQNESLPALEDKFLATYFSSVHPGSVVINLASSGFMAYSSDRQNPILPRLFGVVDDIFCLFEGHIQNVAHLKQQYGLNKTANEVIIVIEAYRTLRDRGPYPADQVVRDIQGKFAFVLFDSASNNAFVASDADGSVPFFWGTDADGHLVLSTDGEVVKQGCGKTFAPFPKGCFYTSSGGLRSYEHPVNELKAVPRVDSSGEVCGLTFKVDAESRKGNTGMPRVGSDANWSQNY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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