当前解析结果
SmilChr08G001580| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001580 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001580 |
| 描述 | protein LIFEGUARD 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 13041748 - 13043942 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001126 |
|---|---|
| GeneID | 131001126 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001126 |
| 原始查询 | LOC131001126 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein LIFEGUARD 4-like |
| 产物 | protein LIFEGUARD 4-like |
| Arabidopsis | AT1G03070 (AT1G03070)Bax inhibitor-1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839581] identity=50.6; qcov=0.979; evalue=7.92e-76; confidence=high |
| Rice | Os03g0795600 (OSJNBb0021G19.11)- identity=51.8; qcov=0.908; evalue=5.88e-73; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01027 (Bax1-I) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001126 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 1.00000 | XP_057783356.1 |
| 2 | Secretory vesicle | Secretory vesicle | 0.60000 | XP_057783356.1 |
| 3 | Vesicle | 囊泡 | 0.60000 | XP_057783356.1 |
| 4 | Endosome | 内体 | 0.60000 | XP_057783356.1 |
| 5 | Endosome membrane | 内体膜 | 0.60000 | XP_057783356.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:13043483 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B38,B39,C72,D6 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783356.1PF01027
Bax1-I 30-238 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783356.1 |
Pfam | PF01027 |
Bax1-I | Domain | 30 | 238 | 6.9e-46 | 157.4 | Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。