当前解析结果
SmilChr08G001590| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001590 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001590 |
| 描述 | protein XRI1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 13150130 - 13153166 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001135 |
|---|---|
| GeneID | 131001135 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001135 |
| 原始查询 | LOC131001135 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein XRI1-like |
| 产物 | protein XRI1-like |
| Arabidopsis | AT5G48720 (XRI1)x-ray induced transcript 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834930] identity=46.7; qcov=1.03; evalue=8.46e-78; confidence=high |
| Rice | Os01g0918100- identity=36.5; qcov=1.06; evalue=2.71e-46; confidence=medium |
| GO | GO:0007140 (male meiotic nuclear division); GO:0007143 (female meiotic nuclear division) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27749 (XRI1_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001135 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783370.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783370.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783370.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783370.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057783370.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783370.1PF27749
XRI1_C 262-296 aa
XP_057783371.1PF27749
XRI1_C 262-296 aa
XP_057783372.1PF27749
XRI1_C 261-295 aa
XP_057783373.1PF27749
XRI1_C 257-291 aa
XP_057783374.1PF27749
XRI1_C 256-290 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783370.1 |
Pfam | PF27749 |
XRI1_C | Domain | 262 | 296 | 1.1e-19 | 70.5 | XRI1 C-terminal domain |
XP_057783371.1 |
Pfam | PF27749 |
XRI1_C | Domain | 262 | 296 | 1.1e-19 | 70.5 | XRI1 C-terminal domain |
XP_057783372.1 |
Pfam | PF27749 |
XRI1_C | Domain | 261 | 295 | 1.1e-19 | 70.5 | XRI1 C-terminal domain |
XP_057783373.1 |
Pfam | PF27749 |
XRI1_C | Domain | 257 | 291 | 1e-19 | 70.5 | XRI1 C-terminal domain |
XP_057783374.1 |
Pfam | PF27749 |
XRI1_C | Domain | 256 | 290 | 1e-19 | 70.5 | XRI1 C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。