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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G001595

染色体: Chr08 坐标: 13186861-13190989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G001595
名称SmilChr08G001595
描述type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 6-like
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向13186861 - 13190989 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131001138
GeneID131001138
locus_tag-
NCBI NameLOC131001138
原始查询LOC131001138

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 6-like
产物type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 6-like
ArabidopsisAT1G05470 (CVP2)
DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837048]
identity=64.44; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
RiceOs07g0175900
-
identity=58.77; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
GOGO:0004439 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0004445 (inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity); GO:0034485 (phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0046856 (phosphatidylinositol dephosphorylation)
KEGG-
PfamPF22669 (Exo_endo_phos2)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131001138

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Cytosol 细胞质基质 0.80000 XP_057783379.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057783379.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:13188425 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B99
Chr8:13188448 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B105,B26,C20,C85,D1
Chr8:13188630 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B37,B4,D10
Chr8:13189341 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B139
Chr8:13189368 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B134,C11,C69
Chr8:13189369 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A21,B121,B70,C16
Chr8:13189729 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B99
Chr8:13189764 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B13
Chr8:13190444 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B23
Chr8:13190494 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783379.1
602 aa
N
1
301
602
Exo_endo_phos2
Exo_endo_phos2
C
PF22669 Exo_endo_phos2 105-169 aa PF22669 Exo_endo_phos2 328-560 aa
XP_057783380.1
602 aa
N
1
301
602
Exo_endo_phos2
Exo_endo_phos2
C
PF22669 Exo_endo_phos2 105-169 aa PF22669 Exo_endo_phos2 328-560 aa
XP_057783381.1
602 aa
N
1
301
602
Exo_endo_phos2
Exo_endo_phos2
C
PF22669 Exo_endo_phos2 105-169 aa PF22669 Exo_endo_phos2 328-560 aa
XP_057783382.1
601 aa
N
1
300
601
Exo_endo_phos2
Exo_endo_phos2
C
PF22669 Exo_endo_phos2 104-168 aa PF22669 Exo_endo_phos2 327-559 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057783379.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 105 169 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783379.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 328 560 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783380.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 105 169 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783380.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 328 560 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783381.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 105 169 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783381.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 328 560 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783382.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 104 168 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
XP_057783382.1 Pfam PF22669 Exo_endo_phos2 Domain 327 559 1.1e-72 245.7 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057927396.1
TACAGCTGAAAAAAGGATTTGTATTTAGCCCTTTTTGTCATATCTACACTCTTCTTGCTGACCAGCACAAGTTTGTGAAAAATAATTCGAGATTTTAATCAGAATTTGAAGGATATGTGTTTGGACTTTTGTTTATGAAGATGGAATGTGAGTTCCATCAAAGAAATCGACCATTATGTTTGATTAGTAATAAAAATTATGTGTTGGATTGTTTGTGATAGTTAATGAATTTTGATTTGAGTAGAGAAAAATGGCATGGA...
XM_057927397.1
TACAGCTGAAAAAAGGATTTGTATTTAGCCCTTTTTGTCATATCTACACTCTTCTTGCTGACCAGCACAAGTTTGTGAAAAATAATTCGAGATTTTAATCAGAATTTGAAGGATATGTGTTTGGACTTTTGTTTATGAAGATGGAATGTGAGTTCCATCAAAGAAATCGACCATTATGTTTGATTAGTAATAAAAATTATGTGTTGGATTGTTTGTGATAGTTAATGAATTTTGATTTGAGTAGAGAAAAATGGCATGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783379.1_42335
ATGAAAGATGAAAATTGCAGACAGAGCAAGCTCTCTTGGTCAAAGAAACTGGTTAGGAAATGGTTCAATATTAAGTGCAAAGGTGAGGAATTTCAGGCTGATGAAGAAGCTGTTTATGGAGGGGGTGAAATGGAGTGGAGAAGTTGCTTCTCTGAAAGGGAGCCATTTACAATCAAGAAAAGTAAAACAGAAGATTCAGCAAAGAACATGGAGCGTTCCTTTTCGCGTTCAAGGTCCCGGTCCAGGCGAGGGAGAGGCTA...
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783380.1_42336
ATGAAAGATGAAAATTGCAGACAGAGCAAGCTCTCTTGGTCAAAGAAACTGGTTAGGAAATGGTTCAATATTAAGTGCAAAGGTGAGGAATTTCAGGCTGATGAAGAAGCTGTTTATGGAGGGGGTGAAATGGAGTGGAGAAGTTGCTTCTCTGAAAGGGAGCCATTTACAATCAAGAAAAGTAAAACAGAAGATTCAGCAAAGAACATGGAGCGTTCCTTTTCGCGTTCAAGGTCCCGGTCCAGGCGAGGGAGAGGCTA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057783379.1
MKDENCRQSKLSWSKKLVRKWFNIKCKGEEFQADEEAVYGGGEMEWRSCFSEREPFTIKKSKTEDSAKNMERSFSRSRSRSRRGRGYLDHPQILNIQNYSVFVSTWNVGGKPPRSNMNLDDWLHSAPSADVYVLGFQEIVPLNAGNILGAEDNGPAKKWLALIKRTLDNAPGTSGVGGCYTSSPMPDPVAEWNADFEGSSRNKASTFLPRRSFQTPPQRWNMDNDMSIPQPPLDRRLSVCDRVIFGHRQSDFGANVRWGC...
XP_057783380.1
MKDENCRQSKLSWSKKLVRKWFNIKCKGEEFQADEEAVYGGGEMEWRSCFSEREPFTIKKSKTEDSAKNMERSFSRSRSRSRRGRGYLDHPQILNIQNYSVFVSTWNVGGKPPRSNMNLDDWLHSAPSADVYVLGFQEIVPLNAGNILGAEDNGPAKKWLALIKRTLDNAPGTSGVGGCYTSSPMPDPVAEWNADFEGSSRNKASTFLPRRSFQTPPQRWNMDNDMSIPQPPLDRRLSVCDRVIFGHRQSDFGANVRWGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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