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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001619`

染色体: Chr08 坐标: 13414637-13416081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001619`
名称	SmilChr08G001619
描述	uncharacterized SmilChr08G001619
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13414637 - 13416081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001163`
GeneID	`131001163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001163`
原始查询	`LOC131001163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	C-8 sterol isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837045]; symbol=AT1G05440; hit=AT1G05440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	C-8 sterol isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837045]; symbol=AT1G05440; hit=AT1G05440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G05440` (AT1G05440) C-8 sterol isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837045] identity=39.4; qcov=0.867; evalue=3.65e-65; confidence=medium
Rice	`Os03g0747100` - identity=33; qcov=0.821; evalue=4.49e-37; confidence=low
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF04622 (ERG2_Sigma1R)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057783428.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057783428.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057783428.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057783428.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057783428.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13414693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B68
`Chr8:13414810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:13414827`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr8:13414827`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr8:13414982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C11,C69
`Chr8:13415246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:13415291`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr8:13415291`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr8:13415655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B2,B24
`Chr8:13415697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,D4
`Chr8:13415726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A20,B46,B82,C20,C23,C48,D2
`Chr8:13415727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A20,B46,B82,C20,C23,C48,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783428.1

369 aa

184

369

ERG2_Sigma1R

PF04622 ERG2_Sigma1R 192-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783428.1`	Pfam	`PF04622`	ERG2_Sigma1R	Family	192	317	7.7e-08	32.7	ERG2 and Sigma1 receptor like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927445.1
ATGACTTCAAGAAAACACAAAACTCTCGAAGAAACCACGAAAATGGCGATGCAGACGCCAAATTCCTCTGTCAAATCGTCGCTCACAGTGGACACCAATCCATCAGAAACGAGAGACATTTTCTATTTCCCAGGCTGCAAGAAAGATGCCAACTGCAAGTGCGAAATCTGCATCGCCAGCATAAACGCGACGCTCGATTTGATGCCGCAGAGCACCAACCGAAGCTCCTTCACAAAATCCTATGCCCCACGATCCTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001163
ATGACTTCAAGAAAACACAAAACTCTCGAAGAAACCACGAAAATGGCGATGCAGACGCCAAATTCCTCTGTCAAATCGTCGCTCACAGTGGACACCAATCCATCAGAAACGAGAGACATTTTCTATTTCCCAGGCTGCAAGAAAGATGCCAACTGCAAGTGCGAAATCTGCATCGCCAGCATAAACGCGACGCTCGATTTGATGCCGCAGAGCACCAACCGAAGCTCCTTCACAAAATCCTATGCCCCACGATCCTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783428.1
MTSRKHKTLEETTKMAMQTPNSSVKSSLTVDTNPSETRDIFYFPGCKKDANCKCEICIASINATLDLMPQSTNRSSFTKSYAPRSFISRSPVSFNSSSADLSTPKSSARTMTGVPASPTPGLTERICRQKRRNDDLKYGVFLLRTFWCLILVFGVEYGASWMVSGVAKARLSPEFVKNLGSKSRDFESLSGRLEFLKNELERLVGGDVLGCSSVDHSLWKINQDGLLLTSRCVLYESMIEEVSIWGWPLQTAGLLAAEYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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