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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001628`

染色体: Chr08 坐标: 13476192-13477889 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001628`
名称	SmilChr08G001628
描述	FHA domain-containing protein At4g14490
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13476192 - 13477889 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001174`
GeneID	`131001174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001174`
原始查询	`LOC131001174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FHA domain-containing protein At4g14490
产物	FHA domain-containing protein At4g14490
Arabidopsis	`AT4G14490` (AT4G14490) SMAD/FHA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827096] identity=26.6; qcov=1.06; evalue=3.19e-33; confidence=low
Rice	`Os03g0728500` - identity=43; qcov=0.322; evalue=5.19e-24; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00498 (FHA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783471.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057783471.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783471.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783471.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13476456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:13476591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:13476640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B136,B51,B61
`Chr8:13476641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr8:13476728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B81,B87,C18,C46
`Chr8:13476786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B136,B51,B61
`Chr8:13476869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B45,B62,B77
`Chr8:13477056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B45,B62,B77
`Chr8:13477245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:13477246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B136,B51,B61
`Chr8:13477294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B81,B87,C18,C46
`Chr8:13477304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B29,B3,B78,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783471.1

419 aa

210

419

FHA

PF00498 FHA 40-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783471.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	40	112	2.8e-16	60.4	FHA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927488.1
AAATCCAACTCGAAATCTCCTATGCGATCTTCACTTCCAAATGGAACCGTGAACCATCGATGGTCGGAACCGATTGGACCTAAACCACGCGCAACATCATCCTTCTCATTTCATAATCGCGCTCAACACAAATTCAAAATTTTCGGCAAACAAAAAGAAAAGAAAGAACTAAAAAAACCCTTCCGTCTATTCTTCCCCAAAATCACTAACCCTACCCGGCAATTCAAACCAAGCCCGAAAGAATGCCTCCGAGAAGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001174
ATGCCTCCGAGAAGATCTGCCGCCGCCGGAGAAGACCAGGGCCCGACGCTGAAGCTAATCGTGGAAAAGGGACCGCTATCGGGAACAACAAGAGAGTTCAAGCCGGGAAAAAAGGTCCAGATCGGCCGCCTTGTCCGCGGCAACTCGCTAACTATCAGGGACGCCGGAATCTCCTCCAACCACCTGCTCATCCAAGCCGAAGAAGCGCCGGAGCCGGACGGCCGGCGCTGGACCATCTCCGACCTCGATTCCTCCAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783471.1
MPPRRSAAAGEDQGPTLKLIVEKGPLSGTTREFKPGKKVQIGRLVRGNSLTIRDAGISSNHLLIQAEEAPEPDGRRWTISDLDSSNGTILNGARLEPFETTALSHGDVIKIGELTSITVEIVSGADNEVGSGMRRNPRRRVREQPADLGVIDEFAELGLQNNVDEEKIEVEAKQGRNANTRKTRNSAKNENLAKGLNIEEVRDLGPSGIKGSRVLSTRSTRSSRKEENIDEIAVDLSVIEGKKTTRGGGRVKKLFVETTC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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