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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004306`

染色体: Chr01 坐标: 61252932-61254255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004306`
名称	SmilChr01G004306
描述	polygalacturonase inhibitor-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61252932 - 61254255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001214`
GeneID	`131001214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001214`
原始查询	`LOC131001214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase inhibitor-like
产物	polygalacturonase inhibitor-like
Arabidopsis	`AT5G06860` (PGIP1) polygalacturonase inhibiting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830577] identity=52.4; qcov=0.933; evalue=1.82e-105; confidence=high
Rice	`Os05g0104600` (PGIP3) - identity=41.2; qcov=0.951; evalue=2.27e-72; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057783524.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057783524.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783524.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783524.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783524.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61253116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:61253118`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,B41
`Chr1:61253118`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:61253121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:61253194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:61253405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:61253415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:61253551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C79,C87
`Chr1:61253575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:61253752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:61253821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:61253846`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B67,B86,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783524.1

329 aa

164

329

LRRNT_2

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 26-65 aa PF00560 LRR_1 119-140 aa PF00560 LRR_1 142-164 aa PF00560 LRR_1 168-187 aa PF00560 LRR_1 261-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783524.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	26	65	5.4e-10	40.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057783524.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	119	140	7.1e-20	67.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783524.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	142	164	7.1e-20	67.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783524.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	168	187	7.1e-20	67.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783524.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	261	282	7.1e-20	67.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927541.1
AACGAAGTTCTATACTGCATAAATATAATGCCAAAAAGAATAAACATAAAAAGAAATATGTAAAGGGCTACATGATTTATTTATACTTTATTTAAAGGTCCATGATTGGTACTGTTTTTATATTGACCGTATACAAGTTTTCCCCTCGTTTTATAATAGGTTTGACAAATATAAATTGGGGCATTTTCCGGATAGTTGTCACACTATTACCATTATCCAAAATTCAAATTCCAATCCATGGCTTCTTCCCATCTTCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001214
ATGGCTTCTTCCCATCTTCCTCTCCTCTTCCTCATTTCTATTTCCTTTCTCTCGGTCTCATTCACAGAGAGGTGCCACCCAAATGACAAGAATACCCTCCTTCAGATCAAGAAAGACCTCAACGACCCTTACTTCCTCATCTCTTGGGATCCCAAAACCGACTGCTGCGACCACTGGTACGTGGTGAAATGCGACGACAAAACCAACCGAATTACCGAATTTGTCCTCGCCCAAACCGATCTCCATCTCCCTATTCCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783524.1
MASSHLPLLFLISISFLSVSFTERCHPNDKNTLLQIKKDLNDPYFLISWDPKTDCCDHWYVVKCDDKTNRITEFVLAQTDLHLPIPAAIGDLPYLQDLTIHACNATGKIPQAISKLSQLNFLDLRQNLLTGPVPSFLGNLKKLTYIGLSRNSLTGSIPPSLSQLPELSGLLLDRNNLTGGIPESFADFKQKSFYLYMSHNQLFGPIPRRLGYTNFTFLDVSRNKLEGDVSFMFGKNKSMNTADFSRNLLQFNLSKVEFSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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