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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001682`

染色体: Chr08 坐标: 14046056-14048365 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001682`
名称	SmilChr08G001682
描述	SART-1 family protein DOT2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14046056 - 14048365 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001226`
GeneID	`131001226`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001226`
原始查询	`LOC131001226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SART-1 family protein DOT2-like
产物	SART-1 family protein DOT2-like
Arabidopsis	`AT5G16780` (DOT2) SART-1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831541] identity=58.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0511500` - identity=54.1; qcov=0.533; evalue=1.77e-99; confidence=medium
GO	GO:0000481 (maturation of 5S rRNA); GO:0045292 (mRNA cis splicing, via spliceosome); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03343 (SART-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001226

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783533.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057783533.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057783533.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783533.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783533.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14046386`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A5,B12,B123,B24,B48
`Chr8:14046386`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A5,B12,B123,B24,B48
`Chr8:14046513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B86,C25
`Chr8:14046858`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A7,B135,B20,B48,B80,B87,C13,C34,C39,C53,C61
`Chr8:14046860`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B48,C13
`Chr8:14046860`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B48,C13
`Chr8:14046898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:14047046`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B43,B87,C4,C6,C67
`Chr8:14047046`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B43,B87,C4,C6,C67
`Chr8:14047282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A15,B3,C14
`Chr8:14047310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:14047422`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B103,B2,B88,C56,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783533.1

638 aa

319

638

SART-1

PF03343 SART-1 48-487 aa PF03343 SART-1 512-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783533.1`	Pfam	`PF03343`	SART-1	Family	48	487	6.2e-64	217.4	SART-1 family
`XP_057783533.1`	Pfam	`PF03343`	SART-1	Family	512	558	6.2e-64	217.4	SART-1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927550.1
AAGCGCCGCCTTCACCTCTAATCCCTATTTCTTCCTATTCTCACGCTACCAGCTCAGCTCGTCTGCAATCTCTCTCTGTTTTCCGCCGCTCGTCGCCCCCTCCGGCCCACGCCGCTCGCCTCGAAATCTCTACAGCAAGCCTGCGCCGTGCTCCGCCTCACTGTGCAGCCTATCAGAGCAGCTCTGCCGACAACTCCCCAACCCACCGCCCAATAGCAGAATGAAAGAACAAAGGTTGATGAAGTCGTCTGAAGGTGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001226
ATGAAAGAACAAAGGTTGATGAAGTCGTCTGAAGGTGCTCCCGAGATTTTATCTTGGGTTAACAAGAGCAGGAAGATTGAAGAGAAAAAATCTCGGGTTAACAAGAGCAGAAAATCTCGGGTTAACAAGAGCAGGAAGATTGAAGAGAAAAAATCCCGGGTTAACAAGAGCAGGAAGATTGAAGAGAAAAGGAATGCTGAGAAGGAGAAAGCATTGCAGCTTTCACGAATTTTTGAGGAGCAGGACAATATGAATATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783533.1
MKEQRLMKSSEGAPEILSWVNKSRKIEEKKSRVNKSRKSRVNKSRKIEEKKSRVNKSRKIEEKRNAEKEKALQLSRIFEEQDNMNMNDEGSDDESAAQDITQHLGGVKVLHGLDKVLEGGAVVLTLKDQSILADGDINEEVDMLENVEIGEQKRKDEAYRDSKKKVGVYDDKFNDEPGVEKKMLPQYDDPVADEGLTLDSTGHFSGEAERKLEELRRRIQGVSASNHGENLNSIGKISTDHYTQEEMAKFKKPKKKKDKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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